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利用数据挖掘技术分析HIF-1α在胃癌中的预后意义

2018-04-21孙美涛自加吉严长宝戴莉萍

大理大学学报 2018年2期
关键词:数据挖掘胃癌数据库

孙美涛,自加吉,陈 莹,严长宝,戴莉萍,余 敏,熊 伟*

(1.大理大学基础医学院,云南大理 671000;2.大理大学第三附属医院病理科,云南大理 671000;3.云南大学生命科学学院,昆明 530061)

胃癌是消化系统最常见的恶性肿瘤之一,具有发病率高、转移率高和死亡率高等特点〔1〕。我国是胃癌高发区,发病率以中老年居多,目前有低龄化趋势,给家庭和社会带来极大危害〔2〕。胃癌的发生是多基因多阶段参与的涉及多种环境因素及遗传因素长期的相互作用〔3〕。因此,进行胃癌的病因学研究,对胃癌进行有效的病因预防,具有十分重要的意义。

缺氧诱导因子(Hypoxia-inducible factors,HIF)是介导细胞对缺氧微环境进行适应性反应的关键转录调控因子〔4〕。HIF-1α基因首先是由Semenza等在低氧处理肝癌细胞株Hep3B时发现的,第一个被证实的HIF-1α靶基因是人类促红细胞生成素(Human erythropoietin,HuEPO)基因。在细胞适应低氧环境和肿瘤发展的过程中HIF-1α扮演着重要的角色〔5〕。HIF-1α基因定位于人类第14q23.2,含有16个外显子,存在3个不同的转录本,其完整的转录本2(NM_001530.3)的全长cDNA为4 082 bp,编码的蛋白质由826个氨基酸残基组成。研究发现,HIF-1是由氧调节的α亚基和组成性表达的β亚基构成的异二聚体转录因子。其中HIF-1α亚基是感受氧和介导生理性或病理性缺氧反应的关键因子〔6〕。HIF-1作为低氧条件下最重要的调控因子,参与细胞多种缺氧反应。在缺氧的条件下,HIF-1α的表达水平增高,是调节细胞内氧代谢的关键因子之一,可以调节包括血管内皮生长因子、葡萄糖转运蛋白1在内的众多靶基因的表达。同时HIF-1α在能量代谢和细胞增殖等方面也起到重要的作用〔7-9〕。……

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