黄秋葵果实转录组测序及分析
2018-04-08李和平姚运法练冬梅赖正锋洪建基
生物技术通报 2018年3期
李和平 姚运法 练冬梅 赖正锋 洪建基
(福建省农业科学院亚热带农业研究所,漳州 363005)
黄秋葵(Abelmoschus esculentus)为锦葵科秋葵属植物,是一种众所周知的天然的、健康的蔬菜品种,广泛分布于非洲、亚洲、美洲等地区,非洲和亚洲的种植面积超过了99%[1]。黄秋葵荚果中富含不饱和脂肪酸、膳食纤维、活性多糖、维生素等[2],经常食用帮助消化、增强体力、保护肝脏、健胃整肠,而且荚果中含有黄酮、类黄酮、叶黄素、生物碱和微量元素,能增强机体的抗病能力[3-5]。王君耀等[6]研究小鼠经黄秋葵水提取液灌胃15 d,然后进行游泳、耐缺氧等实验,结果显示黄秋葵水可以明显提高小鼠耐缺氧能力及耐寒耐热能力,降低小鼠剧烈运动后血乳酸水平,因而具有抗疲劳作用。由于其果实具有较高的营养价值,并且可以提高运动耐力,欧美等国把它列入21世纪最佳绿色食品名录之中,并被许多国家作为运动员首选蔬菜。黄秋葵被认为是次要的作物,直到现在都很少人关注其遗传改良工作。
转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理,已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。在锦葵科植物中棉花的转录组研究最多,有针对棉花纤维早期发育的[7]、有针对根部水胁迫的[8]、有研究苗期棉花杂种优势的[9]等。而黄秋葵作为一个小物种,研究报道比较少,Roland等[10]对黄秋葵叶片和果实进行了转录组测序,获得了叶片和果实基因表达的基本信息;……
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