吴娟子　钱晨　张建丽

摘要：从象草中克隆了基因，并对其进行了初步的生物信息学分析。利用转录组测序获得的表达序列信息，设计1对特异性的PCR引物，应用RT-PCR技术从象草中扩增出CpCCoAOMT2基因。对获得的基因进行序列同源性搜索、结构域搜索及3D结构预测、分子系统进化树构建等生物信息学分析。测序结果表明，CCoAOMT2基因全长926 bp，含110 bp的5′-UTR、741 bp的CDS和75 bp的3′-UTR，共编码246个氨基酸，GenBank登录号为BankIt1975804；Blastn和BlastT分析结果显示，[WTBX][STBX]CpCCoAOMT2[WTBZ][STBZ]基因及其编码的蛋白在核苷酸水平和氨基酸水平上与多种植物的CCoAOMT基因和CCoAOMT蛋白具同源性；预测CpCCoAOMT2蛋白相对分子质量为27 253，等电点为508，是一个不含跨膜结构域、不含信号肽分子的亲水性、稳定蛋白。分子进化树分析结果表明，CpCCoAOMT2蛋白与禾本科植物的CCoAOMT蛋白亲缘关系最近，与裸子植物和蕨类植物关系较近，而与双子叶植物的关系较远。

关键词：象草；咖啡酰酸辅酶A-O-甲基转移酶；基因克隆；生物信息学分析

中图分类号： Q785文献标志码：

文章编号：1002-1302（2017）16-0033-04

收稿日期：2016-12-14

基金项目：国家自然科学基金（编号：31302025）；江苏省农业科技自主创新资金[编号：CX（14）5035]；国家牧草产业技术体系盐城综合试验站項目（编号：CARS-35）；浙江省宁波市科技计划（编号：2016C10018）。

作者简介：吴娟子（1977—），女，湖北京山人，博士，副研究员，主要从事牧草育种和产业化关键技术研究。E-mail：jzwu2014@jaasaccn。

象草（Cenchrus purpureus Schum）是一种多年生禾本科C4植物，具有高生物量，高光合效率、多用途、不占用耕地的优点。它是世界上生物量最高的草本，年生物量可达45 t/hm2。它可作为草食畜禽的优质青饲料，理想的水土保持作物，高质量人造板、纸浆和木质纤维素类能源的优质原料[1-7]。……