李丽, 缪中纬，辛清武，朱志明, 章琳俐，庄晓东，郑嫩珠,3

（1福建省农业科学院畜牧兽医研究所，福州 350013；2福建昌龙集团，福建漳州 363000;3福建农林大学食品科学学院,福州351100）

畜牧·兽医·资源昆虫

半番鸭与番鸭精巢组织差异表达转录组测序分析

李丽1, 缪中纬1，辛清武1，朱志明1, 章琳俐1，庄晓东2，郑嫩珠1,3

（1福建省农业科学院畜牧兽医研究所，福州 350013；2福建昌龙集团，福建漳州 363000;3福建农林大学食品科学学院,福州351100）

【目的】研究半番鸭与番鸭精巢组织转录组差异表达基因，为进一步阐明半番鸭不育的遗传机制奠定理论基础。【方法】利用转录组测序方法对半番鸭和番鸭的精巢组织进行研究，筛选其差异表达基因，并对其功能进行注释和荧光定量PCR(quantitative real-time PCR, QRT-PCR)验证。【结果】测序共获得43.84Gb Clean Data，组装后共获得193 535条Unigene。DESeq分析发现3 597个基因在两个鸭品种间差异表达，其中上调基因1 194个和下调基因2 403个，包括与生殖功能相关的基因，如成纤维细胞生长因子（fibroblast growth factor, FGF）、蛋白激酶A（protein kinaseA, PKA）、丝裂原活化蛋白激酶7（mitogen-activated protein kinase 7-like, partial, BMK）、生长因子受体结合蛋白2（growth factor receptor-bound protein 2, GRB2）、c-Jun氨基末端激酶(c-Jun N-terminal kinase, JNK)和肿瘤坏死因子受体超家族成员6（tumor necrosis factor receptor superfamily member 6, FAS）等。GO (gene Ontology)分析发现382个差异基因获得功能注释，其中97个基因涉及发育繁殖生物学过程。KEGG (kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析表明差异表达基因共富集到 50 条信号通路中，其中 17个通路显著富集，包括丝裂原活化蛋白激酶信号转导通路(mitogen-activated protein kinase signaling pathway, MAPK)、甘油酯代谢（glycerolipid metabolism）以及钙信号途径 (calcium signaling pathway)信号通路等，与生殖功能密切相关的有促性腺激素释放激素信号通路（gonadotropin releasing hormone (GnRH) signaling pathway）和MAPK信号转导通路。经QRT-PCR验证，差异基因表达变化模式与转录组测序结果一致，测序结果可靠。……