鸭茅EST-SSR标记在4种禾草上的可转移性
2017-09-29王新宇张新全黄琳凯
王新宇,张新全,黄琳凯,聂 刚
(四川农业大学动物科技学院草业科学系,四川 成都 611130)
鸭茅EST-SSR标记在4种禾草上的可转移性
王新宇,张新全,黄琳凯,聂 刚
(四川农业大学动物科技学院草业科学系,四川 成都 611130)
为了检验鸭茅EST-SSR标记在几种禾本科植物上的可转移性并筛选出可应用于后续研究的引物,本研究用40对可在鸭茅(Dactylisglomerata)上扩增产物的鸭茅EST-SSR引物,分析了6份多花黑麦草(Loliummultiflorum)、6份高羊茅(Festucaarundinacea)、3份扁穗牛鞭草(Hemarthriacompressa)和3份牛鞭草(H.altissima)共18份材料的转移率、遗传多样性和亲缘关系。结果表明,多年生黑麦草和高羊茅可转移率为60%,扁穗牛鞭草和牛鞭草转移率最低,均为50%,26对引物共获得条带128条,多态性条带121条,多态性比(PPB)为94.53%,平均扩增出多态性条带4.92条,平均多态性信息量0.952。18份材料遗传相似系数范围为0.208~0.974,在遗传系数为0.68时,4个物种分别独自聚为一大类。本研究证实利用鸭茅EST序列开发的EST-SSR在有一定亲缘关系的物种间转移是可行的,可转移的引物对未来禾本科遗传育种研究有一定的参考价值。
鸭茅;多花黑麦草;高羊茅;扁穗牛鞭草;牛鞭草;EST-SSR;转移性
SSRs即简单重复序列(simple sequence repeat),又称微卫星DNA,是一种由1~6个碱基为重复单位的DNA序列[1],不论真核生物还是原核生物都有广泛且随机的分布。SSR标记与其它分子标记相比有明显的优势:SSRs有较高的丰度、较高的信息含量、较高的多态性、较多的共显性遗传和较多的重复性[2]。所以,其已被广泛用于SSR遗传连锁图谱构建[3]、 DNA指纹图谱的构建[4]、遗传多样性的研究[5]、标记辅助选择育种[6]和品种鉴定[7]等。……
