李奕基 梁培★

曼氏迭宫绦虫cathepsin L样蛋白酶的生物信息学分析

李奕基1，2梁培1，2★

目的通过生物信息学预测曼氏迭宫绦虫cathepsin L样蛋白酶（Smcathepsin L样蛋白酶）的生物学特征及其潜在功能和结构，为下一步Smcathepsin L样蛋白酶参与寄生虫和宿主相互作用过程研究提供依据。方法通过NCBI的ORF finder工具对Smcathepsin L样蛋白酶的开放阅读框（ORF）进行分析，利用ExPASy网站进行蛋白的物理化学参数、信号肽、跨膜螺旋和潜在分子生物学功能的预测，通过NCBI/BLAST对蛋白保守功能域进行预测。从NCBI网站获取不同物种的cathepsin L样蛋白酶序列，并利用Vector NTI suit 8.0和TreeView软件进行分析。利用SWISS⁃MODEL网站和SPDBV 4.10软件分析Smcathepsin L样蛋白酶的三维空间结构。结果Smcathepsin L样蛋白酶是一个全长基因，编码336个氨基酸。蛋白由2个典型的cathepsin L样蛋白酶结构域组成，序列当中有信号肽，是一个稳定的可溶性蛋白分子。三维空间立体结构分析结果显示Smcathepsin L样蛋白酶是一个保守的蛋白。Smcathepsin L样蛋白酶编码氨基酸序列与细粒棘球绦虫、链状带绦虫、多房棘球绦虫和人的cathepsin L样蛋白酶基因的同源性分别是50%、50%、49%和46%。分子进化分析显示Smcathepsin L样蛋白酶与日本血吸虫、多房棘球绦虫和链状带绦虫亲源性更近，而与其他物种，例如原虫、线虫和哺乳动物亲源性较远。结论Smcathepsin L样蛋白酶可能是一个潜在的分泌蛋白，该蛋白能在胞外发挥作用，即在寄生虫的消化、转移、入侵及宿主⁃寄生虫相互作用中起着重要的作用，是一个具有潜在研究价值的多功能分子。

曼氏迭宫绦虫；cathepsin L样蛋白酶；生物信息学分析

作者单位：1.海南医学院……