TaqMan-MGB荧光探针法检测北京地区幽门螺杆菌gyrA基因第87位密码子和第91位密码子耐药突变
2017-08-22沈维祥胡泽斌陈春峰张小燕成虹郜恒骏
沈维祥,胡泽斌,陈春峰,张小燕,成虹,郜恒骏
TaqMan-MGB荧光探针法检测北京地区幽门螺杆菌gyrA基因第87位密码子和第91位密码子耐药突变
沈维祥*,胡泽斌*,陈春峰,张小燕,成虹,郜恒骏
目的采用 TaqMan-MGB 荧光探针法检测北京地区幽门螺杆菌喹诺酮类耐药位点 gyrA 基因第 87 位密码子和第91 位密码子突变情况,比较与药敏试验和一代测序法的一致性。
方法收集北京大学第一医院消化内科门诊尿素酶试验阳性的患者 252 例,所有患者均使用 MGB 荧光探针法和一代测序法对喹诺酮类耐药位点 gyrA 基因第 87 位密码子和第 91 位密码子进行检测。其中 158 例患者同时进行药敏试验检测,同时分析耐药位点突变发生率与耐药表型的关系。
结果158 例传统培养联合药敏法检测的标本中成功培养出 85 例,占 53.8%,其中耐药型菌株 40 例,敏感型菌株42 例。而 MGB 荧光探针法成功检出 155 例,占 98.1%,其中野生型 93 例,突变型 62 例。在药敏试验检测出的85 例阳性标本中,两种方法检出的符合率为 94.1%。252 例标本中,一代测序法成功检测出 234 例,占 92.9%,其中野生型 160 例,突变型 74 例。在 74 例突变型标本中,含 gyrA 基因第 87 位密码子突变的标本占 60.8%,含 gyrA 基因第 91 位密码子突变的标本占 39.2%。MGB荧光探针法成功检测出 250 例,占 99.2%,其中野生型161 例,突变型 89 例。在 89 例突变组标本中,含 gyrA 基因第 87 位密码子突变的标本占 64.0%,含 gyrA 基因第91 位密码子突变的标本占 36.0%。一代测序法和 MGB 荧光探针法在区分是否含有突变上的符合率为 95.3%。
结论TaqMan-MGB 荧光探针法可快速、敏感地检测患者胃黏膜标本中幽门螺杆菌喹诺酮类耐药位点 gyrA 基因第87 位密码子和第 91 位密码子的突变情况,与药敏试验和一代测序法有较高的符合性。……
