六味地黄丸对绝经期肾阴虚骨质疏松症的基因表达调控数据分析

2017-08-06卢严方林贯川刘倩倩刘梦宜马文丽潘星华

中国骨质疏松杂志 2017年3期

关键词：分析

卢严方林贯川刘倩倩刘梦宜马文丽潘星华

南方医科大学基础医学院，广东广州 510515

六味地黄丸是宋代钱乙创制的滋阴补肾的方剂，由熟地黄、酒萸肉、牡丹皮、山药、茯苓、泽泻组成，为补益剂，具有滋阴补肾之功效。现代药理研究也已证实六味地黄方剂具有治疗骨质疏松、增强免疫功能、抵抗衰老病症及其他功效[1-2]。

随着中药现代化的不断推进和基因芯片的广泛应用，在中医药治疗疾病方面产生了大量的基因芯片数据，然而由于数据分析技术的局限性，大量的数据并没有得到充分的利用，因此本研究针对美国国家生物信息中心(National Center for Biotechnology Information，NCBI)上六味地黄丸治疗骨质疏松症方面的功效相关数据集进行基因表达谱差异及其相关功能机制的分析。

1 材料与方法

1.1 GEO数据集

本研究所采用的与六味地黄丸相关的基因表达谱数据(登录号为GSE57273)，是从NCBI数据库GEO(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)中下载，在GEO Series数据库搜索框中以“Liuwei Dihuang Pill”为检索词，获得由Xie等人提交的芯片数据GSE57273。GSE57273所用的实验平台是Agilent公司的014850人类全基因组芯片4x44K G4112F(特征数版)，采取患者骨外周血进行芯片检测，共有3例患者，6个样本，其中六味地黄丸治疗绝经期肾阴虚骨质疏松症前样本数为3个(对照组)，治疗3个月后样本数为3个(实验组)。生物芯片检测对组织样本数的最低要求为3个，3个就已经达到生物学重复，有统计学意义。此数据样本病例的纳入标准和排除标准以及合并用药均有严格详细的规范[3]。