周 妍, 刁晨曦, 张圆圆, 于海波, 陆涛峰, 赵丽丽, 陈洪岩

(1. 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 兽医生物技术国家重点实验室/黑龙江省实验动物与比较医学重点实验室, 实验动物与比较医学创新团队, 哈尔滨 150069; 2. 东北农业大学生命科学学院, 哈尔滨 150030; 3. 牡丹江师范学院生命科学与技术学院, 牡丹江157011)

·禽类实验动物的研究与应用·

SPF鸡不同生长阶段粪便菌群组成及多样性研究

周 妍1,2, 刁晨曦1,3, 张圆圆1, 于海波1, 陆涛峰1, 赵丽丽1, 陈洪岩1

(1. 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 兽医生物技术国家重点实验室/黑龙江省实验动物与比较医学重点实验室, 实验动物与比较医学创新团队, 哈尔滨 150069; 2. 东北农业大学生命科学学院, 哈尔滨 150030; 3. 牡丹江师范学院生命科学与技术学院, 牡丹江157011)

目的 提供SPF鸡不同生长阶段肠道菌群的组成及多样性数据。方法 采集10日龄、12周龄、23周龄和52周龄SPF鸡粪便，利用Illumina HiSeq 2500高通量测序方法，对样品16S rRNA的两个高变区(V3-V4)进行测序分析，并进行了a-多样性指数、b-多样性指数和粪便群落特征分析。结果 四个生长阶段粪便样品菌群具有相似的较高的丰富度和良好的均匀度，物种多样性无显著差异(P>0.05); 厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)丰度占95%以上; 乳杆菌属(Lactobacillus)、链球菌属(Streptococcus)、拟杆菌属(Bacteroides)、肠球菌属(Enterococcus)为优势菌属，不同时期丰度差异达显著水平(P<0.05)。结论 四个生长阶段菌群组成多样，且优势菌群主要为有益菌。该实验结果能够为SPF鸡品质评定、健康监测和安全性评价提供依据。

SPF鸡; 不同生长阶段; 粪便菌群; 16s rRNA; Illumina HiSeq 2500高通量测序

SPF鸡可以安全可靠地排除特定微生物及所携带病原体的干扰，其机体、胚及胚细胞可被用于肿瘤免疫学、药物学、毒理学、血清和疫苗制造以及生物学鉴定等方面，因此在国内、外应用广泛。S……