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仙台病毒核酸测序检测方法的建立

2017-07-19张欢欢余陈欢戴方伟郎秋蕾应华忠

实验动物与比较医学 2017年3期
关键词:检测

张欢欢, 余陈欢, 戴方伟, 马 月, 郎秋蕾, 王 瑜, 应华忠

(1. 浙江省医学科学院浙江省实验动物中心, 杭州 310013;

2. 杭州联川生物技术有限公司, 杭州 310018)

仙台病毒核酸测序检测方法的建立

张欢欢1, 余陈欢1, 戴方伟1, 马 月1, 郎秋蕾2, 王 瑜2, 应华忠1

(1. 浙江省医学科学院浙江省实验动物中心, 杭州 310013;

2. 杭州联川生物技术有限公司, 杭州 310018)

目的 建立仙台病毒(SeV)的核酸测序检测方法。方法 根据SeV序列设计覆盖不同毒株的通用引物,然后优化成测序引物并摸索建库条件,进行核酸测序和结果分析。结果 获得1对特异性强的通用引物,序列为: 上游引物5'-GCTGCAAAACGCTGTGGG-3',下游引物5'-TGGRACYTCAGAAAGAATRGG-3'; 建库条件优化为:第一轮以cDNA为模板用通用引物扩增,第二轮以第一轮产物为模板用测序引物扩增。测序分析可以有效地将SeV与其他微生物区分开,并且精确到TianJin 亚株。结论 建立了SeV核酸测序检测方法,为后续SeV感染实验动物的检验检疫提供依据。

仙台病毒(SeV); 核酸测序; 检测

仙台病毒(Sendai virus, SeV), 亦称副流感病毒1型或血凝病毒(HVJ), 是副粘病毒科的一种单股负链RNA病毒[1]。SeV传染性强、易扩散, 是严重危害实验动物的传染病之一, 同时也是人类呼吸道感染的重要病源。由于其与人类副流感病毒血细胞吸附第2型(HA-2)病毒同属副流感病毒I型, 二者间有十分密切的抗原关系[2], 常散发或混合在流感流行中, 可引起婴幼儿下呼吸道严重疾病。啮齿类动物感染SeV会对其淋巴细胞转化、致瘤作用及繁殖等产生影响, 从而影响实验结果; 此外, 动物一旦感染很难清除,严重影响幼鼠生长发育并降低成年鼠的繁殖率[3]。……

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