双偏振极化干涉技术实时研究三磷酸腺苷与其适配体相互作用
2017-07-12胡涛杨帆杨秀荣
胡涛++杨帆++杨秀荣



摘要 利用双偏振极化干涉(Dual polarization interferometry,DPI)测量技术实时研究了三磷酸腺苷(AP)与其适配体(APbinding aptamer, ABA)间的相互作用。将单链ABA固定在DPI氮化硅芯片上,采用DPI技术实时监测AP与固定的ABA的相互作用过程中敏感层的质量、厚度、密度的变化。通过详细分析敏感层质量变化,得到AP与ABA间的结合速率常数 (ka=466 × 103 L/(mol·s)、解离速率常数(kd =170 × 10 ymbolm@@ 2·s ymbolm@@ 1)、结合常数 (KA=27 × 105 L/mol)和解离常数(KD =37 × 10 ymbolm@@ 6 mol/L)。通过测定敏感层质量、厚度和密度随AP浓度的变化,分别建立了测定AP的方法,检出限(LOD, 3σ)分别为022 μmol/L(质量变化)、014 μmol/L(厚度变化)、032 μmol/L(密度变化)。本研究利用DPI技術揭示了ABA与AP相互作用中结构变化的实时信息,构建了新型AP传感器,用于实际血清样品中AP的检测,结果令人满意。
关键词 双偏振极化干涉; 核酸适配体; 三磷酸腺苷; 相互作用
1引 言
核酸适配体是通过指数富集配体系统进化(ELEX)技术,从随机单链寡聚核苷酸文库中筛选出的DNA或RNA寡聚核苷酸\[1\]。核酸适配体对相关配体具有高特异性和高亲和性,与抗体相比,适配体具有免疫原性低、靶分子范围广、价格低廉、可快速体外合成以及容易修饰等优点。因此,基于核酸适配体构建的生物传感器在蛋白质研究\[2\]、药物检测\[3\]、临床诊断\[4\]等方面得到了广泛应用。研究核酸适配体与靶分子间的相互作用过程,对于研究其相互作用机理,构建适配体传感器,具有重要的参考意义。高效液相色谱\[5\]、原子力显微镜\[6\]、电泳\[7\]、聚合酶链反应\[8\]、等温滴定量热法和荧光光谱技术\[9,10\]都被用来研究适配体和靶分子间的相互作用过程。……
