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系统性红斑狼疮患者中miR-410表达及其靶基因生物信息学分析①

2017-07-05欧大明黄丽芳欧阳琳邹礼衡

中国免疫学杂志 2017年6期
关键词:数据库信号分析

张 济 欧大明 黄丽芳 欧阳琳 邹礼衡

(南华大学附属第一医院风湿免疫科,衡阳421001)

·临床免疫学·

系统性红斑狼疮患者中miR-410表达及其靶基因生物信息学分析①

张 济 欧大明 黄丽芳 欧阳琳 邹礼衡

(南华大学附属第一医院风湿免疫科,衡阳421001)

目的:检测miR-410在系统性红斑狼疮患者(SLE)中的表达水平,运用生物信息学方法研究miR-410及其靶基因在SLE发生发展过程中的作用。方法:定量检测miR-410在SLE患者外周血单个核细胞中的表达水平,并通过miR-410序列分析,靶基因预测和Genecards数据库分析,进一步对其靶基因进行GO富集和KEGG Pathway分析。结果:miR-410在SLE患者中表达显著降低,其核苷酸序列在多物种间呈高度保守性。受miR-410调控且与SLE疾病相关的潜在靶基因包括FASLG、CSF2、IFNAR2、MAPK1、PLCG2、IL4等。GO分析发现miR-410的靶基因参与细胞生长增殖、程序性死亡、细胞分化、免疫系统发育等多个生物过程。KEGG Pathway分析发现miR-410的靶基因显著富集在肿瘤途径信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路、胶质瘤信号通路、黑色素瘤信号通路、TGF-β和JAK-STAT 信号通路等。结论:miR-410可能通过直接靶向作用其调控靶分子,影响SLE患者体内多条信号通路的网络调控,从而参与SLE疾病的发生和发展。

miR-410;SLE;靶基因;GO富集;KEGG信号通路

系统性红斑狼疮(Systemic lupus erythematosus,SLE)是一种多发于青年女性的累及多脏器的自身免疫性炎症性结缔组织病,由于免疫细胞过度增生激活,产生大量的自身抗体,并与体内相应的自身抗原结合形成相应的免疫复合物,沉积在皮肤、关节、小血管、肾小球等部位,导致皮肤黏膜、骨骼肌肉、心脏、肾脏及神经系统等多个组织器官损伤。……

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