王 配 王淑燕 霍金龙 李罗刚 张永云 李卫真 朱宏涛 姚茂东

(云南农业大学 云南省版纳微型猪近交系重点实验室，昆明650201)

·免疫学技术与方法·

版纳微型猪近交系SLA-DOA基因克隆、mRNA表达及蛋白质功能生物信息学分析①

王 配 王淑燕②霍金龙 李罗刚 张永云③李卫真④朱宏涛④姚茂东④

(云南农业大学 云南省版纳微型猪近交系重点实验室，昆明650201)

目的：克隆版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)白细胞抗原DO座位alpha亚基(SLA-DOA)的编码序列，并对其19个重要组织mRNA表达作半定量分析。方法：RT-PCR方法获得SLA-DOA的全长cDNA序列；半定量RT-PCR方法分析其在BMI重要组织的mRNA表达谱，并运用生物信息学对其核酸及蛋白序列进行分析，构建系统进化树。结果：BMISLA-DOAcDNA长度为1 079 bp，编码250个氨基酸，蛋白质分子量为27.81 kD，等电点为6.48；位于猪7号染色体，由4个外显子和3个内含子构成；其mRNA高表达于淋巴结和胃，低表达于心脏、皮肤和十二指肠，在其他14种组织中不表达；SLA-DOA蛋白存在1个信号肽，1个跨膜螺旋，3个保守域，4个O连接的糖基化位点，18个磷酸化位点，位于细胞质的概率是94.1%；系统进化分析表明，在所选择的6个物种中，BMI(猪)与牛的亲缘关系最近。结论：本研究成功克隆了版纳微型猪近交系SLA-DOA基因并进行了生物信息学功能分析和多种组织表达分析，为版纳微型猪近交系的异种器官移植研究奠定基础。

猪白细胞抗原DO座位alpha亚基；版纳微型猪近交系；组织表达；生物信息学

MHC是主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex)的英文简称，位于脊椎动物有核细胞表面，由MHC基因家族(MHC Ⅰ类基因、Ⅱ类基因和……