前列腺癌基因外显子区突变位点筛查及与前列腺癌易感性的关系
2017-06-05糜远源吴升祝黎洁
糜远源,吴升,祝黎洁
(南通大学第三附属医院暨无锡市第三人民医院,江苏无锡214041)
前列腺癌基因外显子区突变位点筛查及与前列腺癌易感性的关系
糜远源,吴升,祝黎洁
(南通大学第三附属医院暨无锡市第三人民医院,江苏无锡214041)
目的 筛查前列腺癌(PCA)基因外显子区的突变位点,并分析其与PCA易感性的关系。方法 6例PCA患者,留取PCA组织和癌旁正常组织标本。采用液相杂交捕获技术分析PCA、癌旁正常组织全基因外显子区的单核苷酸多态性(SNPs),采用Illumina HiSeq 2000平台高通量测序将捕获富集并验证的PCA、癌旁正常组织基因外显子区SNPs的DNA文库进行突变位点比对,筛选PCA基因外显子区突变位点。采用bwa软件与参考基因组hg19作比对,分析PCA外显子区功能性突变位点的生物信息学信息,分析功能性突变位点与PCA易感性的关系。结果 共发现4个未报道的功能性SNPs突变位点,分别为BRCA1 rs16941、MET rs45483396、P53 rs121912655、COPB2 rs7374710。进一步通过临床样本检测结果显示,BRCA1 rs16941与COPB2 rs7374710两个SNP不仅均与PCA易感性相关(OR 分别为 1.47,1.27;95% CI 分别为 1.14~1.72;1.20~1.41),而且与PCA患者PSA值 及Gleason评分均呈正相关(OR分别为1.25,1.37;95%CI= 1.10~1.84,1.20~2.34;P均<0.01)。结论 PCA外显子区存在BRCA1 rs16941、COPB2 rs7374710功能性突变位点,携带有BRCA1 rs16941、COPB2 rs7374710突变位点的个体罹患PCA的可能性较高。
前列腺肿瘤;前列腺癌;液相杂交捕获技术;基因突变;外显子;单核苷酸多态性
2016年最新流行病学数据显示前列腺癌(PCA)仍是美国男性最常见的恶性肿瘤,病死率仅次于肺癌[1]。我国PCA发病率及病死率正逐年升高[2,3]。早期筛查和治疗是一直是PCA研究的热点。目前外周血前列腺特异抗原(PSA)是临床最常用的筛查PCA的指标,虽其诊断PCA复发的敏感度较高,PSA 4 ng/mL阈值诊断PCA的敏感性、特异度均较低[4]。可能原因为前列腺炎症、良性前列腺增生(BPH)及感染时均可出现外周血PSA水平升高[5~7]。……
