刘佳丽王维王子萌范芳梅马毓蓉余林何於娟

1重庆医科大学附属第一医院耳鼻咽喉科（重庆400016）2重庆医科大学检验医学院,临床检验诊断学教育部重点实验室（重庆400016）3重庆市第六人民医院（重庆400080）

·基础研究·

小鼠急性未分型流感嗜血杆菌中耳炎差异基因的互作网络特征分析

刘佳丽1王维2，3王子萌2范芳梅2马毓蓉2余林1何於娟2

1重庆医科大学附属第一医院耳鼻咽喉科（重庆400016）2重庆医科大学检验医学院,临床检验诊断学教育部重点实验室（重庆400016）3重庆市第六人民医院（重庆400080）

目的利用基因表达数据库（GEO）查找小鼠中耳炎表达谱基因芯片原始数据，建立中耳炎基因互作网络图。方法从公共数据库GEO中下载小鼠中耳炎相关数据集，采用Affymetrix Expression Console软件和Tran⁃scriptome Analysis Console（TAC）软件筛选差异表达基因，将差异基因导入STRING在线数据库进行分析，绘制差异基因互作网络图，并将互作网络数据导入Cytoscape 3.4.0软件中，筛选网络中心节点，并取其中相对独立、作用较为集中且与炎症基因相关子网络，采用David在线工具对其进行功能注释富集分析。结果共筛选出1166个差异表达基因，其中表达上调793个，表达下调373个，经STRING在线工具筛选后共有459个小鼠中耳炎差异基因编码的蛋白存在相互作用，并得到相应蛋白互作网络，分析其中与炎症相关子网络。结论本研究利用生物信息学技术构建了中耳炎差异基因互作网络，其中的网络中心节点基因，对于中耳炎分子机制研究及靶向治疗具有指导作用。

未分型流感嗜血杆菌；……