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2014年长沙市活禽市场污水中H5N1亚型禽流感病毒HA、NA及NS基因进化分析

2017-02-17张如胜孙边成陈静芳刘晓蕾欧新华陈发明

中国人兽共患病学报 2017年1期

张如胜,孙边成,姚 栋,叶 文,陈静芳,黄 政,刘晓蕾,欧新华,陈发明

2014年长沙市活禽市场污水中H5N1亚型禽流感病毒HA、NA及NS基因进化分析

张如胜,孙边成,姚 栋,叶 文,陈静芳,黄 政,刘晓蕾,欧新华,陈发明

目的 分析2014年长沙市活禽市场污水中H5N1亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)血凝素(Hemagglutinin, HA)、神经氨酸酶(Neuraminidase, NA)及非结构蛋白(Non-structural,NS)基因进化特征。方法 从2014年长沙市活禽市场采集501份环境标本,利用Real-time PCR方法进行A型、H5、H7和H9亚型流感病毒核酸检测,并对单一H5阳性标本进行核苷酸测序,病毒HA、NA和NS基因测序结果进行在线BLAST分析,利用Mega5和Bioedit软件构建核苷酸进化树和氨基酸(Amino acids,aa)比对。结果 从501份环境标本中检出A型H5亚型病毒阳性标本177份(检出率35.33%),其中8份标本经核苷酸测序鉴定为H5N1亚型病毒,进化分析表明大部分H5N1病毒HA基因位于2.3.2分支内,聚集形成一个新亚分支,NA及NS基因位于2.3.2.1b亚分支。HA蛋白受体结合位点aa为QSG, 表现为禽流感病毒受体特征;NA蛋白未出现H275Y及N295S aa替换,对神经氨酸酶抑制剂敏感;HA、NA及NS蛋白关键分子位点表现为高致病性的分子特征。结论 2014年长沙市活禽市场污水中H5N1亚型禽流感病毒 HA、NA和NS基因表现为高致病性的分子特征,但不具有对人易感的受体特征,需要进一步监测。

活禽市场;环境;禽流感病毒;H5N1亚型;基因;进化

根据流感病毒血凝素(Hemagglutinin, HA)和神经氨酸酶(Neuraminidase, NA)抗原性的不同,A型流感病毒可分为18个HA亚型(H1-H18)和11个NA亚型(N1-N11)[1]。根据禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)对禽致病性的不同,可以分为低致病性禽流感(low pathogenic avian influenza,LPAI)和高致病性禽流感(high pathogenic avian influenza,HPAI)病毒[2]。在这些亚型中,仅仅只有引起禽类高死亡率的H5和H7亚型被认为是HPAI病毒[2]。……

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