CRTC3基因多态性及基因型组合与秦川牛生长性状的关联分析
2016-12-13徐怀超昝林森王洪宝
徐怀超,昝林森,2*,王洪宝,2,宁 越
(1.西北农林科技大学动物科技学院, 杨凌 712100; 2. 国家肉牛改良中心, 杨凌 712100)
CRTC3基因多态性及基因型组合与秦川牛生长性状的关联分析
徐怀超1,昝林森1,2*,王洪宝1,2,宁 越1
(1.西北农林科技大学动物科技学院, 杨凌 712100; 2. 国家肉牛改良中心, 杨凌 712100)
旨在探讨CRTC3基因作为秦川牛生长性状候选基因的可能性,寻找与秦川牛生长相关的分子标记。本研究采用PCR-RFLP方法检测395头健康秦川牛CRTC3基因的多态性,分析其多态位点不同基因型及组合基因型与秦川牛生长性状的关联性。结果发现,CRTC3基因扩增序列区间存在2个SNPs位点(位于外显子区域的G66478C和位于内含子区域的C91297T)。关联性分析表明,在本试验所选取的395头秦川牛群体中, G66478C位点GC基因型个体在体斜长方面极显著高于CC型个体均值(P<0.01),且在胸深方面显著高于CC型个体均值(P<0.05)。在C91297T位点,CT基因型个体均值在体斜长、腰高、尻长和胸深方面显著高于TT基因型个体均值(P<0.01)。CRTC3基因的优势基因型组合CC-TT的个体在腰高、尻长上极显著高于CC-CT基因型组合的个体均值(P<0.01),且基因型组合CC-TT的个体在胸深、胸围显著高于CC-CT组合的个体均值(P<0.05)。综上,可以尝试将CRTC3基因作为影响秦川牛生长性状的候选基因用于标记辅助选择,为秦川牛选育工作提供科学依据。
CRTC3;生长性状;基因型组合;分子标记
生长性状是畜牧业生产中一个重要的经济性状,是衡量育种价值及经济效益的重要指标,寻找相关的分子标记可以缩短对生长性状的选育年限[1]。CRTC3(CREB regulated transcription coactivator 3)是最近发现在葡萄糖和脂质代谢中发挥重要作用的一个蛋白因子,CRTC3属于CREB共活化因子家庭。CRTCs是一个主要调节CREB转录因子活性的蛋白质家族,2003年首先由诺华制药公司的科研人员利用基因组高通量筛选发现。CRTCs首次发现时被命名TORC(Transducer of regulated CREB)[2],CRTCs基因被证实存在于果蝇、鼠及人类中。哺乳动物的CRTCs蛋白家族有3个成员,CRTC1、CRTC2和CRTC3。3种亚型在N端同源性高,其高度保守的卷曲螺旋结构域(Coiled-coil domain) 能与CREB的碱性亮氨酸拉链结构域(Basic leucine zipper,bZIP)相结合,提示其对CREB依赖的转录调控可能具有重要作用[3]。……
