华南家鸡MHC-B区域复合微卫星位点LEI0258的遗传多样性与进化研究
2016-12-13黄勋和李丽芝张金枫何丹林张细权陈洁波李威娜杜炳旺钟福生
黄勋和,李丽芝,张金枫,何丹林,张细权,陈洁波,李威娜,杜炳旺,钟福生*
(1. 嘉应学院生命科学学院,梅州 514015; 2. 华南农业大学动物科学学院,广州 510642;3. 广东海洋大学农学院,湛江 524088)
华南家鸡MHC-B区域复合微卫星位点LEI0258的遗传多样性与进化研究
黄勋和1,李丽芝1,张金枫1,何丹林2,张细权2,陈洁波1,李威娜1,杜炳旺3,钟福生1*
(1. 嘉应学院生命科学学院,梅州 514015; 2. 华南农业大学动物科学学院,广州 510642;3. 广东海洋大学农学院,湛江 524088)
旨在应用MHC-B区域复合微卫星位点LEI0258研究华南家鸡的遗传多样性与进化历史。以华南地区和邻省家鸡及商品鸡为试验材料,对微卫星位点LEI0258进行基因分型和测序,分析其遗传多样性和构建中介网络图。结果表明,580份样品共检测到LEI0258的62个等位基因,长度范围为182~501 bp,其中37个为首次发现。华南家鸡LEI0258保持着较高的遗传多样性水平,观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为0.813、0.960和0.957。中山沙栏鸡、文昌鸡和五华三黄鸡的遗传多样性水平明显高于广西三黄鸡。LEI0258的28个等位基因与27种已知MHC血清型相对应。基于LEI0258侧翼区变异信息的中介网络图将62个等位基因分为8条进化枝,其中3条进化枝同样存在于红原鸡中,提示华南家鸡主要起源于红原鸡。部分等位基因存在于特定鸡品种中,可作为品种鉴定的参考依据。结果提示,微卫星位点LEI0258适用于地方鸡群体遗传多样性、血清型鉴定、品种鉴定和进化研究。
主要组织相容性复合体;LEI0258;华南家鸡;多态性;进化;血清型
地方家禽遗传资源是生物多样性的重要组成部分,是未来家禽品种改良和适应生产条件变化、保持生产长期持续发展的遗传基础[1]。……
