基于系统生物学的干扰素-γ建模的信号转导模式分析
2016-11-21齐云峰孙添添常红玲
长春师范大学学报 2016年8期
齐云峰,孙添添,常红玲
(吉林师范大学生命科学学院,吉林四平 136000)
基于系统生物学的干扰素-γ建模的信号转导模式分析
齐云峰,孙添添,常红玲
(吉林师范大学生命科学学院,吉林四平 136000)
干扰素-γ是细胞因子超家族中干扰素家族的成员,具有抗微生物感染及免疫调节等多种生物学功能。系统生物学主要采用系统的方法研究生物体不同层次的建模与仿真、各种信号转导途径、基因调控网络等。本文采用系统生物学建模工具COPASI对干扰素-γ的信号转导进行模拟,并应用统计学方法进行检验,通过模拟分别改变干扰素-γ受体(IFNR)和磷酸酶PP2的初始浓度,研究二者浓度改变对细胞核内STAT同源二聚体浓度变化的影响。进而研究它们在干扰素-γ信号转导过程中的协同作用。
系统生物学;干扰素-γ;信号转导
系统生物学是一门以系统的观点、运用各种先进的生物学手段从整体的角度分析和研究生命机体复杂特性的学科。它通过研究某生物系统各个不同部分之间的相互关系和相互作用,建立整个系统的可理解模型[1-2]。系统生物学主要在生物个体、器官、组织和细胞等基础上,对其建模、生化代谢途径、信号转导途径、基因调控网络以及疾病机制等进行研究[3-4]。
干扰素-γ的信号转导主要通过JAK/STAT信号转导通路实现,受多种因子调节[5],主要有PP2、IRNR、STAT等。STAT含有SH2和SH3结构域,可与特定的含磷酸化酪氨酸的肽段结合。JAK/STAT通路信号转导的最终实现依赖于STAT同源二聚体进入细胞核内并行使其转录激活功能。……
登录APP查看全文
