赵敏，徐宸，贾凌，程廷才，汪长国，戴亚，夏庆友

1 重庆烟草科学研究所，重庆市北碚区天生路2号 400715;

2 家蚕基因组生物学国家重点实验室，重庆市北碚区天生路2号 400715;

3 重庆中烟工业有限责任公司技术中心，重庆市南岸区南坪东路2号 400060

烟草叶面细菌区系检测探针的设计及优化

赵敏1，徐宸1，贾凌2，程廷才2，汪长国3，戴亚3，夏庆友2

1 重庆烟草科学研究所，重庆市北碚区天生路2号 400715;

2 家蚕基因组生物学国家重点实验室，重庆市北碚区天生路2号 400715;

3 重庆中烟工业有限责任公司技术中心，重庆市南岸区南坪东路2号 400060

为快速准确地检测烟草叶面的细菌种群，本研究利用基因芯片技术，采集我国主要烟区主栽品种旺长期叶面微生物进行宏基因组测序，结合生物信息学分析方法，筛选用以检测其中细菌种属特异性的探针。宏基因组数据分析表明，烟草叶面的宏基因组整体质量值较高，Q20、Q30分别占总碱基数99.2%、81.4%，测序长度为100 bp，碱基分布均匀，所获得测序数据可用于后续探针设计。Blast比对结果表明共筛选出候选探针200条，属于9种细菌属，其中属于假单胞菌属的探针有165条。该结果为基因芯片技术应用于烟草叶面的细菌种群的检测提供了坚实的基础。

烟草；叶面；探针；细菌种属

植物叶面作为一个独立的微环境域，通常栖息着细菌、酵母菌、真菌等微生物，形成了微生物种群之间、正常的微生物与宿主之间的微生态体系。微生物的活动是影响植物生长发育的关键因素。其中，细菌是叶面环境中最主要的微生物类群[1]。……