基于cox1和D-loop区序列雷州半岛红树林海区2种野生弹涂鱼的遗传变异
2016-11-12沈自慧黄永胜龙水生黄承勤王中铎
廖 健,贺 亮,张 顺,沈自慧,黄永胜,龙水生,黄承勤,王中铎
(广东海洋大学水产学院,南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室,广东 湛江 524025)
基于cox1和D-loop区序列雷州半岛红树林海区2种野生弹涂鱼的遗传变异
廖健,贺亮,张顺,沈自慧,黄永胜,龙水生,黄承勤,王中铎
(广东海洋大学水产学院,南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室,广东湛江524025)
设计双层洞穴式弹涂鱼捕捉器,于雷州半岛红树林海区捕获弹涂鱼类野生群体,筛选出弹涂鱼(Periophthalmus modestus)、大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)2个优势种群,并获取其线粒体控制区(D-loop)和cox 1基因部分序列,进行序列变异分析及遗传分析。结果表明,cox 1基因和D-loop区碱基组成A+T含量均大于C+G。cox 1数据揭示,大弹涂鱼变异位点占总长度2.1%,弹涂鱼占2.4%,种内平均遗传距离分别为0.003、0.006,种间遗传距离为0.158,37个个体共定义22个单倍型,单倍型多样性为0.950 45。而D-loop区数据指明,大弹涂鱼变异位点占总长度4.9%,弹涂鱼占7.5%,种内平均遗传距离分别为0.012、0.019,种间距离为0.409,37个个体定义32个单倍型,单倍型多样性水平极高(0.989 49)。中性检验结果显示,2种弹涂鱼进化历程符合中性进化假设,且存在群体扩张的可能。综合cox 1基因和控制区数据显示:弹涂鱼种群遗传多样性高于大弹涂鱼。
红树林;弹涂鱼;捕捉器;序列变异;系统进化
弹涂鱼类(mudskipper)隶属于虾虎鱼科背眼虾虎鱼亚科,我国常见的有大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)、弹涂鱼(Periophthalmus modestus)、青弹涂鱼(Scartelaos histophorus),主要分布于广东、广西、海南等地的河口、潮沟及红树林海区附近滩涂[1]。弹涂鱼类在物种进化上处于极重要位置,是一类进化程度较低的两栖穴居鱼类。……
