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基于线粒体16S rRNA基因的14种造礁石珊瑚系统发育关系分析

2016-11-12廖宝林肖宝华杨小东谢子强

广东海洋大学学报 2016年4期
关键词:系统研究

廖宝林,肖宝华,2,杨小东,谢子强

(1.广东海洋大学深圳研究院,广东 深圳 518108,2.广东海洋大学,广东 湛江 524025,3.深圳市碧海蓝天海洋科技有限公司,广东 深圳 518108)

基于线粒体16S rRNA基因的14种造礁石珊瑚系统发育关系分析

廖宝林1,肖宝华1,2,杨小东1,谢子强3

(1.广东海洋大学深圳研究院,广东 深圳 518108,2.广东海洋大学,广东 湛江 524025,3.深圳市碧海蓝天海洋科技有限公司,广东深圳 518108)

通过16S rRNA基因特异扩增测序,对惠州大亚湾大辣甲岛和小辣甲岛附近海域14种造礁石珊瑚16S rRNA基因片段序列进行了比较分析。结果表明,该片段序列的平均 A+T含量为 63.5%,所有物种的序列碱基AT含量大于GC含量,序列都处于高度饱和的状态。14种造礁石珊瑚的平均遗传距离为0.179。采用NJ、ML和ME法构建系统发育树,结果显示蜂巢珊瑚科单独作为分支处于发育树的基部,而第二支分支包括菌珊瑚科、鹿角珊瑚科、滨珊瑚科和枇杷珊瑚科。裸肋珊瑚科的腐蚀刺柄珊瑚聚到了蜂巢珊瑚科中,与传统形态学分类存在差异,提示造礁石珊瑚表型的变异性可能对传统分类存在影响。

造礁石珊瑚; 16S rRNA;分子系统学

造礁石珊瑚属于刺胞动物门(Cnidaria)珊瑚纲(Anthozoa)六射珊瑚亚目(Hexocorallia)石珊瑚目(Scleractinia),主要分布于地球赤道南北纬30°以内的海域[1]。由造礁石珊瑚组成的珊瑚礁生态系统是世界上第二大生态系统。过去造礁石珊瑚的分类主要通过其骨骼结构作为标准。近30年来,通过分子生物学手段对造礁石珊瑚亲缘关系鉴定已进行了广泛的研究,随着研究的深入,很多结果都与传统形态学鉴定结果存在一定的差异[2-3],显示了全面研究造礁石珊瑚分类的必要性。……

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