泰山螭霖鱼线粒体COⅠ基因序列的遗传多样性分析
2016-11-11巩俊霞付佩胜张金路
杨 玲,巩俊霞,付佩胜,李 娴,张金路
(山东省淡水水产遗传育种重点实验室,农业部黄河下游渔业资源环境科学观测实验站,山东省淡水渔业研究院,山东济南 250117)
泰山螭霖鱼线粒体COⅠ基因序列的遗传多样性分析
杨 玲,巩俊霞,付佩胜,李 娴,张金路*
(山东省淡水水产遗传育种重点实验室,农业部黄河下游渔业资源环境科学观测实验站,山东省淡水渔业研究院,山东济南 250117)
[目的]通过克隆泰山螭霖鱼的COⅠ基因序列,研究其与鲤科几属鱼类的进化关系,确定泰山螭霖鱼的分类地位。[方法]以泰山螭霖鱼30个个体为材料,对其线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)的部分序列进行PCR扩增和序列对比,检测泰山螭霖鱼的遗传多样性;计算泰山螭霖鱼不同单倍型与GenBank中鲤科5个属鱼类的遗传距离,采用聚类分析方法,构建NJ和UPGMA系统进化树。[结果]30个个体泰山螭霖鱼线粒体COⅠ基因片段长度约1 600 bp,无碱基的插入和缺失,纯化并去除引物序列后获得约1 493 bp的核苷酸序列,存在6种单倍型,共检测到6个多态位点,包括4个转化、2个颠换,其单倍型多样性(Hd)为0.460,核苷酸多样性(Pi)为0.000 78,平均核苷酸差异数(K)1.163。遗传距离和NJ和UPGMA系统进化树表明,泰山螭霖鱼与多鳞白甲鱼的COⅠ序列一致,泰山螭霖鱼所在的突吻鱼属与光唇鱼属的亲缘关系最近,与金线鲃属、倒刺鲃属、华鲮属的亲缘关系较远。[结论]该研究为其种质资源的管理与保护及遗传育种提供分子生物学依据。
泰山螭霖鱼;COⅠ;遗传多样性
泰山螭霖鱼(Varicorhinussp.)属鲤科鲃亚科突吻鱼属,是生活在泰山海拔270~800 m山涧溪流中的一种小型野生鱼类,其肉嫩味美、营养丰富,具有独特的药用保健价值[1],是泰山特有的珍贵生物,也是我国“五大贡鱼”之一[2]。……
