羌活(Notopterygium incisum)nrDNAITS和cpDNA rpl20-rps12序列分子进化特点的分析
2016-11-09杨路存刘何春周学丽徐文华周国英
杨路存 刘何春 周学丽 徐文华 周国英*
(1.中国科学院西北高原生物研究所,810008; 2.中国科学院藏药研究重点实验室,西宁 810008; 3.中国科学院大学,北京 100049; 4.青海省铁卜加草原改良试验站,西宁 810008)
* 通信作者:E-mail:zhougy@nwipb.cas.cn
羌活(Notopterygiumincisum)nrDNAITS和cpDNArpl20-rps12序列分子进化特点的分析
杨路存1,2刘何春1,3周学丽4徐文华1,2周国英1,2*
(1.中国科学院西北高原生物研究所,810008;2.中国科学院藏药研究重点实验室,西宁 810008;3.中国科学院大学,北京 100049;4.青海省铁卜加草原改良试验站,西宁 810008)
应用PCR产物直接测序法分析了羌活居群间nrDNA(核糖体DNA)ITS序列和cpDNA(叶绿体DNA)rpl20-rps12的碱基差异,从而初步研究两套植物基因组的变异速率。采用改良的CTAB法从硅胶干燥的羌活叶片中提取总DNA,并对nrDNA ITS和cpDNA rpl20-rps12区域进行扩增、纯化、测序。nrDNAITS序列共有635 bp,有变异位点17处,变异位点百分率为2.68%,(G+C)含量为57.83%。cpDNA rpl20-rps12序列共有767 bp,有变异位点35处,变异位点百分率4.56%,(G+C)含量为33.06%。比较发现,羌活nrDNAITS区域较cpDNA rpl20-rps12序列保守,变异速率较慢。通过对ITS和rpl20-rps12序列单倍型(haplotype)进行分析发现,两者得出的结论一致,即现有分布范围经历了居群近期范围扩张。因此,羌活nrDNA ITS序列适合该种的谱系地理学研究。
羌活;ITS序列;rpl20-rps12序列
羌活(Notopterygiumincisum)隶属于伞形科(Umbelliferae)羌活属(Notopterygium),是中国的特有种[1~2]。主要分布在青海、甘肃、四川[3]。生于海拔2 500~3 500 m的高山灌木林、亚高山灌丛、草丛及高山林缘地上。羌活与同属的宽叶羌活(N.forbesii)同为药材羌活的基源植物,以根茎及根入药[4],是中、藏、羌医药体系中常用药材,主要含挥发油和香豆素类成分。具有散寒、祛风、除湿、止痛功效,主治风寒感冒头痛、风湿痹痛等症,现代药理研究表明对心脑血管疾病也有确切疗效[5]。……
