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滨麦蔗糖:果聚糖6-果糖基转移酶(6-SFT)基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析

2016-11-08贺晓岚王建伟赵继新李文旭陈新宏

麦类作物学报 2016年5期
关键词:物种

贺晓岚,王建伟,赵继新,李文旭,武 军,陈新宏

(1.西北农林科技大学农学院/陕西省植物遗传工程育种重点实验室,陕西杨凌 712100; 2.凯里学院环境与生命科学学院,贵州凯里 556011; 3.河南省农业科学院小麦研究所,河南郑州 450002)



滨麦蔗糖:果聚糖6-果糖基转移酶(6-SFT)基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析

贺晓岚1,王建伟2,赵继新1,李文旭3,武 军1,陈新宏1

(1.西北农林科技大学农学院/陕西省植物遗传工程育种重点实验室,陕西杨凌 712100; 2.凯里学院环境与生命科学学院,贵州凯里 556011; 3.河南省农业科学院小麦研究所,河南郑州 450002)

为了挖掘和利用滨麦(Leymusmollis,2n=4x=28,JJNN)的优良基因,以拓宽小麦非生物胁迫抗性基因资源,以滨麦为材料,利用RT-PCR结合RACE技术从滨麦叶片中克隆到 6-SFT基因cDNA的全长序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,其cDNA全长为2 086 bp,开放阅读框为1 866 bp(命名为 Lm-6-SFT),编码621个氨基酸;其推导的蛋白分子量为69.1 kDa,理论等电点(pI)为5.18,属于酸性蛋白。保守结构域分析表明,该基因推导的氨基酸序列含有SDPDG、RDP和EC结构域。多序列比对及进化树分析表明,滨麦6-SFT与冰草6-SFT在氨基酸水平具有高度的序列相似性。

滨麦; 6-SFT基因;克隆;序列分析

果聚糖是蔗糖与一个或多个果糖分子相连接形成的不同链长的多聚体[1]。果聚糖是生物体内一种重要物质,不仅为植物提供生长所需能量,还在干旱、冷及高盐等非生物胁迫下参与渗透调节[1-2]、细胞膜稳定性维护[3]及信号传导等生理过程[4-5]。在麦类作物中有三种酶参与果聚糖的合成[6],其中,蔗糖:果聚糖6-果糖基转移酶(Sucrose:fructan 6-fructosyltransferase,6-SFT)是禾本科植物果聚糖合成过程的关键酶[7]。……

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