不同氮处理茶树实时定量PCR内参基因筛选和验证
2016-09-18刘圆王丽鸳韦康成浩张芬吴立赟胡娟
刘圆,王丽鸳,韦康,成浩,张芬,吴立赟,胡娟
不同氮处理茶树实时定量PCR内参基因筛选和验证
刘圆,王丽鸳*,韦康,成浩*,张芬,吴立赟,胡娟
中国农业科学院茶叶研究所 国家茶树改良中心,浙江 杭州 310008
为筛选不同氮处理下茶树()实时荧光定量PCR(qRT-PCR)试验体系中最佳内参基因,以茶树幼叶、成熟叶和幼根为材料,应用qRT-PCR分析、、、、-tubulin、等6个内参基因在不同氮浓度和氮源处理下的表达变化,借助GeNorm和NormFinder程序对候选内参基因稳定性进行评价。结果表明,在不同氮浓度和氮源处理下,、-actin和表达稳定性较好,+组合稳定性最佳,可用作茶树基因表达研究的内参基因;而-tubulin和表达稳定性较差,不适合做内参基因。为进一步证实上述结果,分别以、-tubulin 、+组合为内参基因,分析茶树幼叶中硝酸根转运蛋白基因()和铵根转运蛋白基因()的表达水平,发现以和+组合为内参基因时,目的基因的相对表达量随处理时间延长变化规律基本一致;而以-tubulin为内参基因时,目的基因的变化规律与前两者存在明显差别。因此,根据特定试验体系选择合适的内参基因对于qRT-PCR定量结果的准确性和可靠性具有重要意义。
茶树;内参基因;氮处理;qRT-PCR
实时荧光定量PCR(Quantitative real-time reverse-transcriptase PCR, qRT-PCR)因其定量准确、灵敏度高、重复性好、高通量等特点已广泛应用于基因表达水平检测[1-3]。在qRT-PCR相对定量检测中,为避免不同样品在RNA质量、逆转录效率和PCR反应条件上可能存在的差异,通常选择相应的内参基因进行校正和标准化[4-5]。然而,近年来的研究表明,在不同组织、器官、发育时期和不同试验条件下都稳定表达的内参基因并不存在[6-7],因此,根据特定试验体系选择稳定表达的内参基因,已成为qRT-PCR结果准确可靠的重要前提。……
