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一株基因克隆干扰菌的鉴定及其发酵液降解DNA活性分析

2016-09-14刁文涛王雪妍陈晓飞冯菲宁萌周伏忠

生物技术通报 2016年8期

刁文涛王雪妍陈晓飞冯菲宁萌周伏忠

(1. 河南省科学院生物研究所有限责任公司,郑州 450008;2. 河南省微生物工程重点实验室,郑州 450008)

一株基因克隆干扰菌的鉴定及其发酵液降解DNA活性分析

刁文涛1,2王雪妍2陈晓飞1冯菲1宁萌2周伏忠1,2

(1. 河南省科学院生物研究所有限责任公司,郑州 450008;2. 河南省微生物工程重点实验室,郑州 450008)

旨在寻找导致基因克隆失败的原因,检测整个电泳环境中是否存在对DNA有强降解力的菌株。依据菌体形态,革兰氏反应以及16S rDNA序列对DNA降解菌株进行鉴定,琼脂糖凝胶电泳分析菌株对DNA的降解活性。结果显示,从DNA电泳槽中分离到了一株菌,革兰氏染色鉴定为阴性菌,对该菌进行液体培养,利用质粒pUC19作为底物,检测该菌发酵液对DNA的降解能力,发现该菌发酵液能够迅速并彻底地降解DNA,其最佳降解温度为45℃,将该菌命名为DD(DNA degrading)。对该菌的16S rDNA进行测序比对后,发现其与粘质沙雷氏菌(Serrtia marcescens)的16S rDNA序列同源性高达100% 。结合菌体形态,革兰氏反应以及16S rDNA序列结果,DD菌株为一株粘质沙雷氏菌,DNA降解活性分析显示其具有很强的DNA降解能力。

DNA降解;pUC19;粘质沙雷氏菌

现代生命科学的许多领域都会用到分子克隆技术来构建重组载体,在分子克隆的过程中,一般会利用限制性内切酶对目的基因片段进行酶切,回收酶切后的目的基因片段连接到指定的载体中,回收目的基因时一般会用到琼脂糖凝胶回收的方法对目的基因片段进行纯化[1]。而本实验室利用琼脂糖凝胶回收的……

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