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GGTA1-/-五指山小型猪SLAI类基因分子特征及与HLA相似性分析

2016-09-13蒋应弟曾国敏石宁宁李西睿纪慧丽潘登科滚双宝

中国实验动物学报 2016年4期
关键词:研究

蒋应弟,曾国敏,石宁宁,李西睿,纪慧丽,潘登科*,滚双宝

(1. 甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州 730070;2.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业部畜禽遗传资源与种质创新重点实验室,北京 100193;3. 甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州 730070)



GGTA1-/-五指山小型猪SLAI类基因分子特征及与HLA相似性分析

蒋应弟1,2,曾国敏2,3,石宁宁2,李西睿2,纪慧丽2,潘登科2*,滚双宝1*

(1. 甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州730070;2.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业部畜禽遗传资源与种质创新重点实验室,北京100193;3. 甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州730070)

目的明晰α-1,3半乳糖基转移酶基因敲除(GGTA1-/-)的五指山小型猪SLA经典I类基因分子结构特征及其与人HLA的相似性,对研究异种器官移植细胞性排斥反应具有重要意义。 方法 采集6头祖代GGTA1-/-五指山小型猪耳组织,利用RT-PCR对SLAI类基因(SLA-1、SLA-3、SLA-2)扩增、克隆及测序,对序列进行BLAST分析,并采用生物信息学方法对SLAI类基因分子结构特征及其与人HLA的同源性进行分析。 结果测序分析表明,共获得6条等位基因序列,其中4条为已公布的等位基因(SLA-1*0703、SLA-2*1102、SLA-3*0401、SLA-3*0403),另2条为新等位基因(SLA-1*0401wz01、SLA-2*11wz01)。五指山小型猪与人HLA同源性为70.5%~72.1%。SLA-1*0401wz01、SLA-1*0703、SLA-2*11wz01、SLA-2*1102和SLA-3*0401的CD8+分子识别的关键结合域与人HLA氨基酸序列比对,均仅在位点225、228处发生了突变(T→S、T→M),其他位点高度保守。SLA-2*11wz01和SLA-2*1102与人HLAI类基因NK细胞抑制性受体(killerinhibitoryreceptor,KIR)结合区氨基酸同源性较高,在NKTA-1亚型结合域内仅有1个氨基酸差异,而在NKTA-2 和NKTA-3亚型结合域内有2个氨基酸差异。 结论从免疫细胞介导的异种排斥反应角度出发,GGTA1-/-五指山小型猪SLAI类基因氨基酸序列与人HLA高度相似,可作为未来猪-人异种器官移植的良好供体之一。……

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