张衡璐,黄惠敏,叶芝旭,王志华,何志旭,2,,*,舒莉萍2,,4*

(贵州医科大学 1.附属医院儿科学教研室； 2.组织工程与干细胞实验中心；3.免疫学教研室； 4.动物实验中心，贵阳　550004)



斑马鱼核纤层蛋白Lamins的生物信息学分析

张衡璐1,黄惠敏1,叶芝旭1,王志华3,何志旭1,2,3,*,舒莉萍2,3,4*

(贵州医科大学 1.附属医院儿科学教研室； 2.组织工程与干细胞实验中心；3.免疫学教研室； 4.动物实验中心，贵阳550004)

目的了解斑马鱼核纤层蛋白(lamins)的重要遗传信息。方法在UCSC、Vega及Ensemble数据库上收集了不同物种核纤层蛋白家族相关蛋白质序列，利用ClustalX工具进行分析，并用MEGA 4.0 软件绘制进化树；通过NCBI网站上BLAST工具将斑马鱼核纤层蛋白的蛋白质序列与不同物种的相对应的蛋白质序列进行对比，最后将人类、小鼠及斑马鱼的lamins基因信息，进行共线性分析。结果对核纤层蛋白相关基因进行生物信息学分析后显示斑马鱼的核纤层蛋白与人类的相似程度高，推断lmna、lmnb1和lmnb2基因在进化过程中高度保守。结论编码斑马鱼lamins的基因lmna、lmnb1和lmnb2等可能是人类LMNA、LMNB1和LMNB2等基因的直向同源物。

斑马鱼；核纤层蛋白；lmna基因；进化树；共线性分析

近年来, 大量研究表明编码核纤层蛋白的基因尤其是lmna基因突变会引起一系列的疾病, 即核纤层病(laminopathy)。目前已证实有180多种的lmna基因的不同突变引起的疾病[1]，lmna基因突变可导致横纹肌疾病、脂肪代谢障碍综合征、周围神经病变、早衰综合征等[2]。新的动物模型的建立和新技术的应用将会加深对核纤层蛋白病的认识，进而为治疗提供新的思路和途径。……