南移池塘养殖仿刺参肠道菌群结构分析
2016-08-24杨求华黄瑞芳何丽斌
杨求华,陆 振,林 琪,黄瑞芳,何丽斌,葛 辉,周 宸*,杜 虹*
(1.福建省水产研究所,福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室,福建 厦门 361013;2.汕头大学生物系,广东 汕头 515063)
南移池塘养殖仿刺参肠道菌群结构分析
杨求华1,陆振2,林琪1,黄瑞芳1,何丽斌1,葛辉1,周宸1*,杜虹2*
(1.福建省水产研究所,福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室,福建 厦门 361013;2.汕头大学生物系,广东 汕头 515063)
本文基于MiSeq高通量测序技术对南移福建池塘养殖仿刺参(Apostichopusjaponicus)肠道菌落结构进行分析。结果表明,仿刺参前肠(1C_1)、中肠(1C_2)和后肠(1C_3)测得的分类操作单元(OTUs)分别为424、444和414;三组样品的菌群物种丰度没有较大差别,但优势菌种存在较大差异;优势菌群方面,后肠的优势菌群为Haliea属和乳球菌属(Lactococcus)(分别占后肠总菌数的11.97%和10.37%),而前肠和中肠的优势菌群均是乳球菌属和芽孢杆菌属(Bacillus),两者在前肠菌落中的占比分别为27.91%和6.08%,在中肠中的占比分别为33.24%和6.97%。在重复性方面,三组样品的菌落组成都有重叠,重叠率为74.35%,其中前肠与中肠相似度较高,菌株种类有90%以上重叠。本文研究为仿刺参肠道益生菌的开发利用提供基础资料。
MiSeq高通量测序;仿刺参;池塘养殖;肠道菌群
仿刺参(Apostichopusjaponicus),隶属于棘皮动物门、海参纲、刺参科、刺参属,主要分布在西北太平洋沿岸、日本海、朝鲜半岛南部以及中国的黄海、渤海等地[1-3]。我国海参共有140余种,其中以仿刺参的品质最好,位于连云港海州湾的前三岛是仿刺参自然分布的最南界[4]。不过,自2003年起仿刺参的养殖就逐步扩展到福建等南方省份,“北参南养”的成功试验带动了福建省仿刺参养殖产业的蓬勃发展[5],每年的十一月到来年的三月是福建省的仿刺参养殖期[6-7]。……
