魏亚男

(华东师范大学生命科学学院 上海 200241)

建立在生物进化论基础上的“生命之树”概念是由达尔文在其著作《物种起源》中首次明确提出的，认为地球上的一切生命形式都起源于一个共同祖先，并且物种之间的关系及其进化历史有着一种树状结构的关联，这就像一棵树，有树根、树干和枝叶，每一个物种演化水平不同，在生命之树上居于特定位置。生命之树不仅有助于人类理解生命和各大门类生物的起源、演化和彼此之间亲缘关系，还能加深人们对现有生物多样性及其演化历史和趋势的理解和认识。随着形态学、细胞学、生物化学和古生物学等方面证据的不断积累，人们对各类生物的认识逐步加深，生命之树的主干及各级分支的内涵也随之发生变化。

1 生命之树的经典划分

生物的分类已经从18世纪的两界系统发展到20世纪得到广泛认可的的五界系统，即原核生物界、原生生物界、植物界、菌物界和动物界。而各级分支也分别建立了众多的分类系统。例如，被子植物有恩格勒系统、克朗奎斯特系统等；昆虫纲有广义和狭义之分等。

2 生命之树基部分支的变化

分子生物学和计算科学的快速发展, 使得利用核苷酸或氨基酸等分子信息阐明生物类群间的亲缘关系成为可能，经过20余年的积累，人们对生物之树的认识有了新的突破。分子系统学家Woese等[1]使用16srRNA和蛋白质延伸因子E F-T u和E F-G的基因序列和ATP酶基因的α和β两个亚单位序列构建了细菌、古细菌和真核生物三域的系统树，认为系统树的根位于细菌主干之内；……