吴 允，毕榆林，张 扬，郭晓敏，李志腾，万 方，朱鹏飞，徐 璐，常国斌，徐 琪，陈国宏（扬州大学动物科学与技术学院，江苏扬州225009）

中国部分鸡种B-G基因SNP和Indel

吴 允，毕榆林，张 扬，郭晓敏，李志腾，万 方，朱鹏飞，徐 璐，常国斌*，徐 琪，陈国宏
（扬州大学动物科学与技术学院，江苏扬州225009）

鸡的MHC基因家族中B-G基因与鸡抗病性有关，通过研究与抗病有关的B-G基因的多态性可以从根本上提高鸡抵抗疾病的能力，进而为抗病育种奠定基础。试验对25个鸡种基因组DNA进行目标捕获测序，以NCBI中Gallus gallus的B-G基因序列为参考，利用MEGA6软件进行不同鸡种基因序列比对，分析B-G基因外显子和内含子中的SNPs和Indels以及氨基酸的变化，最后制作进化树。结果表明，25个鸡种中外显子存在8个SNPs、19个Indels，内含子有67个SNPs、327个Indels；同时氨基酸序列也呈现出相应的多态性，中国地方鸡种也表现出丰富的遗传多样性。来航鸡、仙居鸡、隐性白羽鸡的B-G基因存在丰富的多态性；来航鸡在进化树上单独为一类，藏鸡、文昌鸡由于地理位置因素也分别为单独一类；现代肉鸡中罗斯与隐性白羽鸡聚为一类；不同类型的中国地方鸡种间同源性较小。中国地方鸡种B-G基因存在多源性进化以及丰富的遗传多样性，进而产生抗病性差异。

鸡；B-G基因；SNPs；Indels；进化树

鸡的主要组织相容性复合体（major histocompatibility complex，MHC）基因是在16号微小染色体上一组紧密连锁的基因簇［1］，其编码的蛋白质在细胞的自我识别中有重要作用，并且其参与细胞免疫和体液免疫［2］。家禽中MHC基因群有2个独立的区域，B基因座和Rfp-Y基因座［3］。……