紫苏PfPDAT基因单核苷酸多态性分析
2016-08-04李璐赵静梁倩孔存翠王计平
李璐,赵静,梁倩,孔存翠,王计平
(山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801)
紫苏PfPDAT基因单核苷酸多态性分析
李璐,赵静,梁倩,孔存翠,王计平*
(山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801)
摘要:[目的] 磷脂:二酰甘油脂酰转移酶(PDAT)是植物油脂合成最后一步酰基化反应的关键酶之一,研究紫苏PfPDAT基因单核苷酸多态性,旨在分析该基因多态性与紫苏种子油脂含量之间的关系。[方法] 以脂肪酸含量不同的7个紫苏品种为试材,通过直接测序法分析PfPDAT基因cDNA全长序列的单核苷酸多态性及其与油脂含量的关系。[结果]在所测总长度为14 679 bp的核苷酸序列中,共检测到9个SNP 和2个InDel,单核苷酸多态性频率分别为1/1 631 bp和1/7 340 bp,其中编码区含2个SNP,非编码区为7个。编码区和非编码区发生SNP的频率分别为1/5 439 bp和1/543 bp。根据PfPDAT 基因序列多态性将供试紫苏材料分为不同的单倍型,单倍型H1和H2中都包含有油脂含量较高和含量较低的材料。[结论]PfPDAT基因的单倍型分类与紫苏油脂含量之间没有显著相关性,同时也反映了植物种子油脂合成的复杂性。
关键词:紫苏; 种子油脂; PfPDAT; 单核苷酸多态性
紫苏(Perilla frutescens)作为一种药食同用的新型油料作物,越来越引起人们的关注[1]。紫苏籽油富含α-亚麻酸,是人体必需脂肪酸,但是不能直接在人体内合成,只能通过食物供给[2],因此,开发基于植物源的α-亚麻酸营养保健产品具有十分重要的意义。目前,有关紫苏α-亚麻酸生物合成积累及调控机制的研究很少。磷脂:二酰甘油脂酰转移酶(PDAT)是植物油脂合成最后一步酰基化反应的关键酶之一,PDAT途径最初是在酿酒酵母中发现的,Oelkers等[3]发现PDAT在酵母中参与对数期TAG的合成。……