Shotgun技术筛选尿液中肾癌蛋白质标志物
2016-08-03付德来李和程刘洪涛王子明
付德来,种 铁,李和程,张 鹏,刘洪涛,王子明
(西安交通大学医学院第二附属医院:1.泌尿外科,2.麻醉科,陕西西安 710004)
·基础研究·
Shotgun技术筛选尿液中肾癌蛋白质标志物
付德来1,种铁1,李和程1,张 鹏1,刘洪涛2,王子明1
(西安交通大学医学院第二附属医院:1.泌尿外科,2.麻醉科,陕西西安710004)
摘要:目的寻找尿液中潜在的肾癌蛋白质标志物。方法收集肾癌患者根治性肾切除术前、术后、非肾癌对照者晨起第二次中段尿液标本,提取尿蛋白并经SDS-PAGE初步分离,尿蛋白酶解后通过高效液相色谱联合电喷雾串联质谱分析,结果整合后经Bioworks Browser 3.1软件搜索SWISS-PROT和/或TREMBL人类蛋白质数据库,鉴定差异蛋白。结果肾癌患者术前组、术后组、对照组分别收集获得满足条件的尿液标本32、32、34份,各组蛋白浓度分别为32.79、9.15、26.57 ug/uL,各组分别鉴定获得独特肽段727、679、753个,独特肽段数≥1的蛋白群分别有278、237、259个,独特肽段数≥2的蛋白群分别有83、92、106个。其中有5个独特肽段数≥2的蛋白群在肾癌术前组特异表达,这5个蛋白中4个为免疫球蛋白类,1个为Lipocalin-2(LCN2)。结论LCN2在肾癌患者术前尿液中高可信表达,LCN2在肾癌发生、发展中的作用及其作为尿液中肾癌标志物的意义值得进一步研究。
关键词:肾癌;标志物;尿液;蛋白组学
肾癌又称肾细胞癌,是最常见的肾脏恶性肿瘤。约30%肾癌患者在首次就诊时已处于疾病晚期,目前晚期肾癌缺乏有效的治疗手段,预后较差。寻找肾癌标志物对于提高肾癌的早期诊断水平,研究肾癌发病机制具有重要意义。尿液是寻找肾癌标志物的理想标本,我们前期通过磁珠联合MALDI-TOF-MS技术从多肽组的层面对尿液中肾癌标志物进行了初步探讨,发现了数个有意义的差异表达多肽峰。……
