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猪流行性腹泻病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立

2016-07-25劳秀杰王静静郑东霞邵春艳何海建王晓洁王志亮王晓杜宋厚辉浙江农林大学动物科技学院浙江杭州00中国动物卫生与流行病学中心山东青岛660金华职业技术学院农业与生物工程学院浙江金华007

中国动物检疫 2016年1期
关键词:检测

劳秀杰,王静静,郑东霞,邵春艳,何海建,王晓洁,王志亮,王晓杜,宋厚辉(.浙江农林大学动物科技学院,浙江杭州 00;.中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛 660;.金华职业技术学院农业与生物工程学院,浙江金华 007)



猪流行性腹泻病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立

劳秀杰1,王静静2,郑东霞2,邵春艳1,何海建3,王晓洁1,王志亮2,王晓杜1,宋厚辉1
(1.浙江农林大学动物科技学院,浙江杭州 311300;2.中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛 266032;3.金华职业技术学院农业与生物工程学院,浙江金华 321007)

摘 要:根据GenBank报道的N基因高度保守核苷酸序列,设计并合成一对引物。上下游引物与GenBank中登录的153株猪流行性腹泻病毒(PEDV)N基因全长序列匹配度分别是100%和97%。以本实验室分离流行毒株为模板,利用SYBR Green I荧光染料法进行RT-PCR扩增,获得扩增产物构建重组质粒作为阳性对照,建立检测猪流行性腹泻病毒核酸的方法。同一样品进行3次重复试验,变异系数<0.9%。通过对临床样品进行检测和测序验证,核酸检测结果中的阳性样品准确率为100%。本研究所建立的荧光定量PCR检测方法具有快速、灵敏、准确等优点,可用于临床PEDV的检测及分子流行病学调查。

关键词:猪流行性腹泻病毒;N基因;实时荧光定量RT-PCR;检测

猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(PEDV)引起猪的一种高度接触性肠道传染病,其特征为呕吐、腹泻、脱水[1]。本病主要发生在当年12月至次年2月,夏季也可发生,可以感染各年龄阶段的猪,其中哺乳仔猪最易感,发病率可达100%,平均死亡率可达50%。……

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