由玉岩， 张成林， 张金国， 阮向东， 张林源， 钟震宇， 郑常明， 刘学锋， 王伟， 曹长雷

(1. 圈养野生动物技术北京市重点实验室 北京动物园， 北京 100044； 2. 国家林业局调查规划设计院，北京 100714； 3. 北京麋鹿生态实验中心， 北京 100076； 4. 长江师范学院， 重庆 408100)

鹿科6属MHC-DRA第二外显子变异特点及与Cytb系统进化比较

由玉岩1， 张成林1， 张金国1， 阮向东2， 张林源3， 钟震宇3， 郑常明1， 刘学锋1， 王伟1， 曹长雷4

(1. 圈养野生动物技术北京市重点实验室 北京动物园， 北京 100044； 2. 国家林业局调查规划设计院，北京 100714； 3. 北京麋鹿生态实验中心， 北京 100076； 4. 长江师范学院， 重庆 408100)

摘 要探讨了鹿科6属动物主要组织相容性复合体dra(mhc-dra)第二外显子的变异特点，揭示其分子水平上的进化选择模式，并与cyt b进行了比较。采用测序法，获得鹿科6属动物dra第二外显子246 bp的序列。研究结果表明，多态性位点数18个，独立变异位点13个。mhc-dra第二外显子显示出较低的核苷酸变异，且6属有各自独特的变异位点。氨基酸序列中抗原结合位点共计20个。其中，鹿科6属动物的氨基酸位点63，驼鹿属氨基酸位点18，是不同于马属和人属的抗原结合位点，推测鹿科动物可能有着不同的抗原结合模式。根据非同义替代率(Ka)和同义替代率(Ks)比值的计算结果，表明鹿属mhc-dra第二外显子为正向选择，其余5属均为纯化选择。对mhc-dra第二外显子及cyt b分别运用邻接法(NJ)，最大似然法(ML)和贝叶斯推论(BI)进行系统发育重建得到相似结果，形成了旧世界鹿类与新世界鹿类的姐妹类群。麂亚科cyt b和mhc-dra第二外显子的基因型可能是鹿亚科与其它亚科之间的过渡型，而气候变化和环境变迁可能是推动mhc-dra第二外显子分化的潜在原因。……