阿霉素诱导下的肝癌细胞HepG2中微小RNA差异表达分析
2016-06-10杨亚蓝郭志云丁若凡茆灿泉郭建秀熊莉丽
杨亚蓝 郭志云 丁若凡 茆灿泉 郭建秀 熊莉丽
(西南交通大学生命科学与工程学院,成都 610031)
阿霉素诱导下的肝癌细胞HepG2中微小RNA差异表达分析
杨亚蓝 郭志云 丁若凡 茆灿泉 郭建秀 熊莉丽
(西南交通大学生命科学与工程学院,成都 610031)
旨在研究阿霉素诱导引起的DNA损伤压力下,肝癌细胞HepG2中参与DNA损伤应答的miRNA,并分析这些miRNA靶基因参与肝癌DNA损伤应答相关的生物学进程与通路。通过小RNA测序检测阿霉素处理肝癌细胞HepG2前后miRNA的差异表达情况,使用GO与KEGG通路富集方法对差异表达miRNA靶基因进行功能富集分析。结果显示,共检测出显著表达差异miRNA 68个,其中上调13个,下调55个。miRNA靶基因的功能分析结果显示,53条miRNAs靶基因显著富集于调控细胞增殖、细胞凋亡、细胞迁移和细胞周期等与DNA损伤应答以及肿瘤相关的生物进程和信号通路,包括p53信号通路、癌症通路、Wnt信号通路和MAPK信号通路等。研究表明,在阿霉素诱导下,HepG2中的差异表达miRNAs与DNA损伤相关的肿瘤生物学进程以及信号通路显著相关,预示这些miRNAs在阿霉素引发的肝细胞癌DNA损伤应答中起着重要的作用。
阿霉素;肝细胞癌;DNA损伤;小RNA测序;microRNAs
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma)是人类最常见的恶性肿瘤之一[1,2]。MiRNA是一种内源性非编码RNA,长度在22个核苷酸左右,它主要是通过特异性结合靶基因3'非翻译区(3'UTR)抑制靶基因的翻译或者直接诱导靶基因的降解从而调控下游靶基因参与的生物进程[3]。研究表明miRNAs参与了由DNA损伤应答相关的多种细胞生物过程,包括细胞增殖、细胞周期调控和细胞凋亡等[4,5]。……
