小麦miRNA研究进展
2016-05-14李洪振宋金鹏�┝醵�升胡文刚宫文萍刘成韩冉刘建军
李洪振 宋金鹏�┝醵�升 胡文刚 宫文萍 刘成 韩冉 刘建军
摘要:microRNA(miRNA)是真核生物体内普遍存在的一类具有重要调控功能的非编码小分子RNA(sRNA)。研究表明,miRNA参与基因转录后调控,在植物的生长、发育和逆境胁迫应答等生物学过程中发挥着重要调节作用。截至目前,对植物miRNA的研究已经取得了较大进展,但小麦miRNA研究才刚具雏形。通过生物信息学预测和sRNA高通量测序手段,已得到部分小麦miRNA。小麦miRNA的功能研究方法也有了初步结果。本文就小麦miRNA的识别、时空表达特性、抗逆相关特性及其功能研究方法进行总结分析,为今后小麦miRNA的研究提供参考。
关键词:miRNA;小麦;高通量测序
中图分类号:S512.101文献标识号:A文章编号:1001-4942(2016)06-0147-05
microRNA(miRNA)是近年来发现的真核生物体内普遍存在的一类具有重要调控功能的非编码小分子RNA(sRNA),其长度在20~25 bp之间。大量研究发现,miRNA参与基因转录后调控,在植物的生长、发育和逆境胁迫应答等生物学过程中发挥着重要的调节作用。迄今,植物miRNA的研究已经取得了较大进展,miRBase数据库(Release 21: June 2014; http://www.mirbase.org)中登录注册的植物成熟miRNA已有10 892条,其中绝大多数miRNA来自全基因组序列已知的水稻(713条)、拟南芥(427条)、二穗短柄草(525条)和玉米(321条)等物种。相比之下,小麦染色体组复杂,基因组庞大,全基因组测序虽已完成[1],但序列组装尚待完成,在miRBase中登录注册的miRNA仅有119条。因此,小麦miRNA研究还需进一步加强。本研究就植物miRNA的生物合成,小麦miRNA的识别、时空表达特性、抗逆相关特性及其功能研究方法进行了总结。
1植物miRNA的生物合成
和动物miRNA不同,大部分植物miRNA基因定位于基因间区域,不成簇聚集[2],其在基因组上具有一个独立的转录单元,可加工成多条miRNA。……
