APP下载

IGF2BP2、CDKAL1基因多态性及基因—环境交互作用与2型糖尿病的关联研究

2016-05-06饶平于鑫玮盖思齐王皓房红红王友

现代仪器与医疗 2016年2期
关键词:多态性基因型位点

饶平 于鑫玮 盖思齐 王皓 房红红 王友信 王嵬

[摘 要] 目的:研究IGF2BP2和CDKAL1基因多态性与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的关联,并探讨基因-环境之间的交互作用。方法:采用病例对照研究方法,在河北省唐山市冀东油田医院体检人群中选取461 例T2DM 患者和434例对照,采用基质辅助激光解析-飞行时间质谱分析技术检测研究对象基因型,运用多因子降维法(multifactor dimensionality reduction, MDR)分析基因-环境交互作用。结果:Logistic回归分析结果显示,IGF2BP2基因rs4402960位点TT 基因型个体患T2DM的风险是TG/GG基因型个体的1.86倍(OR=1.86, 95%CI: 1.01~3.44, P=0.04),rs1470579位点CC基因型个体患T2DM的风险是CA/AA基因型个体的1.91倍(OR=1.91, 95%CI: 1.05~3.46, P=0.03)。吸烟者患T2DM的风险是不吸烟者的1.31倍(OR=1.31, 95% CI: 1.08~1.59, P=0.006)。MDR分析结果显示,rs1470579-吸烟模型的验证样本准确度(0.5862)和交叉验证一致性(10/10)均最高。CDKAL1基因各位点与环境因素均未见交互作用(P>0.05)。结论:在本次调查的人群中,IGF2BP2基因多态性与T2DM 存在关联,IGF2BP2基因rs1470579位点与吸烟因素对T2DM发病存在交互作用。

[关键词] 基因多态性;2 型糖尿病;基因-环境交互作用;胰岛素样生长因子2 结合蛋白2(IGF2BP2)基因;周期依赖性激酶5调控亚基关联蛋白(CDKAL1)基因;多因子降维法

中图分类号:R587.1 文献标识码:A 文章编号:2095-5200(2016)02-021-04

DOI:10.11876/mimt201602008

遗传因素和多种环境因素(吸烟、饮酒、运动量等)在二型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)发生发展中发挥着重要作用[1]。全球T2DM患病人数急剧增加给各国和家庭带来巨大经济负担[2]。随着单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)分析技术发展以及全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)方法应用,大量2型糖尿病易感基因被人们所认识[3]。但大部分研究是以欧洲人群为研究对象,由于种族及地理生活环境不同,不同人群中易感基因或SNPs位点等位基因频率分布可能存在差异。因此,本研究选取在欧洲人群发现的胰岛素样生长因子2结合蛋白2(IGF2BP2)基因和周期依赖性激酶5调控亚基关联蛋白(CDKAL1)基因,探讨以上2个基因及基因-环境交互作用与T2DM发病关联。

1 资料与方法

1.1 研究对象

选择2013年3月至2013年11月在河北省唐山市冀东油田医院就诊的461例汉族T2DM患者为病例组,其中男性274例,女性187例,年龄(53.48±11.33)岁。选择同期在该院体检中心434例健康体检者为对照组,其中男性249例,女性185例,年龄(51.82±12.67)岁。

病例选择纳入标准:1)年龄在30~70周岁;2)符合WHO糖尿病专家委员会1999年提出T2DM诊断标准[4];3)无酮症或其他应激情况;4)签署知情同意书。排除标准:1)1型糖尿病和线粒体糖尿病;2)有糖尿病急慢性并发症;3)未签署知情同意书。

对照选择纳入标准:1)年龄在30~70周岁;2)与病例组患者居住在同一地区;3)签署知情同意书。排除标准:1)患有糖尿病;2)孕妇、恶性肿瘤、严重感染性疾病、严重自身免疫性疾病患者;3)未签署知情同意书。

1.2 方法

1.2.1 一般临床资料收集 使用统一设计流行病学调查问卷,由经过统一培训并合格的调查员对研究对象进行面对面调查,调查内容包括年龄、性别、体质指数(BMI)、吸烟史、饮酒史、劳动量、锻炼情况等。吸烟定义为吸烟≥1支/次且累计时间≥1年,饮酒定义为不论酒种类,饮酒≥1次/周且累计时间≥6个月。根据美国指导方针推荐将工作量分为轻、中、重3个等级,业余锻炼时间分为≥150分钟/周及<150分钟/周[5]。由冀东油田医院实验室依据标准方法进行生化指标测定。

1.2.2 基因组DNA提取 所有研究对象空腹抽取静脉血5mL,充分抗凝处理后置于-20℃冰箱保存备用,采用全血基因组DNA提取试剂盒(北京百泰克生物技术有限公司),对外周静脉血白细胞DNA进行提取。

1.2.3 基因SNP分型检测 选取IGF2BP2基因rs4402960、rs1470579;CDKAL1基因rs4712523、rs4712524、rs10946398位点进行分析。采用基质辅助激光解析-飞行时间质谱分析技术(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight, MALDI-TOF)进行基因分型检测。

1.3 统计学分析

采用SPSS 16.0进行统计处理:计量资料组间比较采用t检验,分类资料组间比较采用χ2检验,Logistic回归分析风险等位基因与T2DM患病风险之间相关性。采用多因子降维法(multifactor dimensionality reduction, MDR)分析上述基因与环境因素之间交互作用。所有数据分析均采用双侧检验,P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 研究对象基本情况及生活方式比较

如表1、2所示,T2DM组平均年龄、BMI、空腹血糖、甘油3酯、胆固醇、低密度脂蛋白、收缩压、舒张压均高于对照组(P<0.001)。T2DM组中吸烟概率明显高于对照组,吸烟者患T2DM风险是不吸烟者1.31倍(OR=1.31, 95%CI:1.08-1.59, P=0.006)。2组性别、尿酸、饮酒、劳动量、业余锻炼时间比较无显著差异(P>0.05)。

2.2 等位基因频率和基因型频率分布

本研究选择的6个位点等位基因频率在病例组和对照组均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),具有群体代表性。IGF2BP2基因rs4402960位点TT基因型个体患T2DM风险是TG/GG个体的1.86倍(OR=1.86, 95%CI:1.01-3.44, P=0.04),rs1470579位点CC基因型个体患T2DM风险是CA/AA个体的1.91倍(OR=1.91, 95%CI:1.05-3.46, P=0.03)。病例组与对照组6个位点基因型分布及等位基因频率比较,无统计学差异(P>0.05)(表3)。

2.3 基因-环境交互作用

分别分析2个基因与吸烟、饮酒、工作量、业余锻炼时间交互作用,结果如表4所示:IGF2BP2基因rs1470579-吸烟模型验证样本准确度(0.5442)和交叉验证一致性(10/10)均最高,符号检验具有统计学意义(P=0.0107)。CDKAL1基因各位点与环境因素均未见交互作用(P>0.05)。

3 讨论

IGF2BP2隶属于mRNA结合蛋白家族,广泛表达于胰腺、肝脏、肠等多种人体组织器官,参与胰腺生长、发育并有刺激胰岛素分泌作用。此外,IGF2BP2可与IGF2 mRNA5′非编码区启动元件结合进而调节IGF-2翻译。IGF-2是胰岛素家族多肽生长因子的一员,可在胰岛素缺乏情况下发挥类似胰岛素作用[6]。IGF2BP2基因位于3q27,具有16个外显子,15个内含子[7]。2007年由3个不同GWAS研究小组发现并报道IGF2BP2基因与T2DM相关[8-10]。本研究结果显示,IGF2BP2基因rs4402960位点TT基因型及rs1470579位点CC基因型与T2DM患病风险升高显著相关,这与欧洲、亚洲人群报道结果基本一致[11-12]。有研究发现IGF2BP2基因多态性与胰岛素分泌受损,尤其是胰岛素早期时相分泌功能下降有关[13]。但Ruchat等通过对712名非糖尿病人群行OGTT试验后发现,IGF2BP2基因多态性与胰岛素敏感性降低有关[14]。研究结论不一可能与研究对象选取、实验方法不同有关,对于IGF2BP2导致T2DM的分子生物学机制,有待进一步探讨。本研究人群并未发现CDKAL1基因多态位点与T2DM发生风险相关,这可能是由于本研究样本量相对较小,未达到足够统计学效力。

本研究发现吸烟者患T2DM风险是不吸烟者1.31倍。吸烟不仅能引起胰岛素介导葡萄糖利用率降低,而且可引起儿茶酚胺等胰岛素拮抗激素分泌增加,导致血糖增加。此外,吸烟可导致脂代谢紊乱,降低机体对胰岛素敏感性进而出现胰岛素抵抗[15]。多项研究发现吸烟显著增加T2DM患病风险,并且每日吸烟数量和每年吸烟盒数与2型糖尿病发生呈正相关关系[16-17]。同时流行病学证据表明[18],被动吸烟同样为T2DM独立危险因素,所以控制公共场所吸烟行为,创建健康公共环境,对降低T2DM发病危险具有重要意义。

T2DM是一种由遗传因素和环境因素共同作用所引发的复杂代谢性疾病,并且基因与基因、基因与运动量、膳食因素、吸烟等之间存在复杂交互作用[19-20]。本研究采用多因子降维法,发现IGF2BP2基因rs1470579位点多态性与吸烟之间存在交互作用,提示rs1470579位点对吸烟存在修饰作用,具体机制尚需进一步研究。本研究未发现CDKAL1基因与环境因素交互作用。

综上所述,本研究发现IGF2BP2基因rs4402960位点及rs1470579位点与我国汉族人群T2DM相关性,并通过多因子降维法发现rs1470579位点与吸烟存在交互作用,对于综合评估个体发病风险,针对高危人群进行早期预防具有一定指导意义。但IGF2BP2基因变异及其与吸烟交互作用是如何增加罹患T2DM风险机制尚不清楚,有待进一步深入研究。

参 考 文 献

[1] DING D, CHONG S, JALALUDIN B, et al. Risk factors of incident type 2-diabetes mellitus over a 3-year follow-up: Results from a large Australian sample[J]. Diabetes Res Clin Pract, 2015, 108(2): 306-315.

[2] GINTER E, SIMKO V. Type 2 diabetes mellitus, pandemic in 21st century[J]. Adv Exp Med Biol, 2012, 771: 42-50.

[3] IMAMURA M, SHIGEMIZU D, TSUNODA T, et al. Assessing the clinical utility of a genetic risk score constructed using 49 susceptibility alleles for type 2 diabetes in a Japanese population[J]. J Clin Endocrinol Metab, 2013, 98(10): E1667-E1673.

[4] GENUTH S, ALBERTI K G, BENNETT P, et al. Follow-up report on the diagnosis of diabetes mellitus[J]. Diabetes Care, 2003, 26(11): 3160-3167.

[5] LIANG S, XIAO-OU S, HONGLAN L, et al. Physical Activity, Smoking, and Alcohol Consumption in Association with Incidence of Type 2 Diabetes among Middle-Aged and Elderly Chinese Men.[J]. Plos One, 2013, 8(11):e77919.

[6] CHRISTIANSEN J, KOLTE A M, HANSEN T, et al. IGF2 mRNA-binding protein 2: biological function and putative role in type 2 diabetes[J]. J Mol Endocrinol, 2009, 43(5): 187-195.

[7] FRAYLING T M. Genome-wide association studies provide new insights into type 2 diabetes aetiology[J]. Nat Rev Genet, 2007, 8(9): 657-662.

[8] SAXENA R, VOIGHT B F, LYSSENKO V, et al. Genome-wide association analysis identifies loci for type 2 diabetes and triglyceride levels[J]. Science, 2007, 316(5829): 1331-1336.

[9] GRARUP N, ROSE C S, ANDERSSON E A, et al. Studies of association of variants near the HHEX, CDKN2A/B, and IGF2BP2 genes with type 2 diabetes and impaired insulin release in 10,705 Danish subjects: validation and extension of genome-wide association studies[J]. Diabetes, 2007, 56(12): 3105-3111.

[10] HORIKOSHI M, HARA K, ITO C, et al. Variations in the HHEX gene are associated with increased risk of type 2 diabetes in the Japanese population[J]. Diabetologia, 2007, 50(12): 2461-2466.

[11] WU Y, LI H, LOOS R J, et al. Common variants in CDKAL1, CDKN2A/B, IGF2BP2, SLC30A8, and HHEX/IDE genes are associated with type 2 diabetes and impaired fasting glucose in a Chinese Han population[J]. Diabetes, 2008, 57(10): 2834-2842.

[12] GROENEWOUD M J, DEKKER J M, FRITSCHE A, et al. Variants of CDKAL1 and IGF2BP2 affect first-phase insulin secretion during hyperglycaemic clamps[J]. Diabetologia, 2008, 51(9): 1659-1663.

[13] HORIKOSHI M, HARA K, ITO C, et al. Variations in the HHEX gene are associated with increased risk of type 2 diabetes in the Japanese population[J]. Diabetologia, 2007, 50(12): 2461-2466.

[14] RUCHAT S M, ELKS C E, LOOS R J, et al. Association between insulin secretion, insulin sensitivity and type 2 diabetes susceptibility variants identified in genome-wide association studies[J]. Acta Diabetol, 2009, 46(3): 217-226.

[15] OHKUMA T, WASE M, FUJII H, et al. Dose- and time-dependent association of smoking and its cessation with glycemic control and insulin resistance in male patients with type 2 diabetes mellitus: the Fukuoka Diabetes Registry[J]. PLoS One, 2015, 10(3): e122023.

[16] RIMM E B, CHAN J, STAMPFER M J, et al. Prospective study of cigarette smoking, alcohol use, and the risk of diabetes in men[J]. BMJ, 1995, 310(6979): 555-559.

[17] UCHIMOTO S, TSUMURA K, HAYASHI T, et al. Impact of cigarette smoking on the incidence of Type 2 diabetes mellitus in middle-aged Japanese men: the Osaka Health Survey[J]. Diabet Med, 1999, 16(11): 951-955.

[18] SUN K, LIU D, WANG C, et al. Passive smoke exposure and risk of diabetes: a meta-analysis of prospective studies[J]. Endocrine, 2014, 47(2): 421-427.

[19] FISHER E, BOEING H, FRITSCHE A, et al. Whole-grain consumption and transcription factor-7-like 2 ( TCF7L2) rs7903146: gene-diet interaction in modulating type 2 diabetes risk[J]. Br J Nutr, 2009, 101(4): 478-481.

[20] YAMAGUCHI M, UEMURA H, ARISAWA K, et al. Association between brain-muscle-ARNT-like protein-2 (BMAL2) gene polymorphism and type 2 diabetes mellitus in obese Japanese individuals: A cross-sectional analysis of the Japan Multi-institutional Collaborative Cohort Study[J]. Diabetes Res Clin Pract, 2015,110(3):301-308.

猜你喜欢

多态性基因型位点
单核苷酸多态性与中医证候相关性研究进展
镍基单晶高温合金多组元置换的第一性原理研究
CLOCK基因rs4580704多态性位点与2型糖尿病和睡眠质量的相关性
二项式通项公式在遗传学计算中的运用*
马铃薯cpDNA/mtDNA多态性的多重PCR检测
GlobalFiler~? PCR扩增试剂盒验证及其STR遗传多态性
西安地区育龄妇女MTHFRC677T基因型分布研究
BAMBI基因敲除小鼠的繁育、基因型鉴定
CYP3A4*1G基因多态性及功能的初步探讨
含内含子的核糖体蛋白基因转录起始位点情况分析