长非编码RNA研究进展及其在油棕环境适应中的调控作用
2016-03-17周丽霞
周丽霞,肖 勇
(中国热带农业科学院椰子研究所,海南省热带油料作物生物学重点实验室,海南文昌 571339)
长非编码RNA研究进展及其在油棕环境适应中的调控作用
周丽霞,肖 勇
(中国热带农业科学院椰子研究所,海南省热带油料作物生物学重点实验室,海南文昌 571339)
综述了长非编码RNAs(lncRNAs)的研究进展,并介绍其在油棕非生物环境胁迫适应性的调控作用,以期为lncRNAs作为调控因子在油棕环境适应中的应用提供参考。
长非编码RNA;环境适应性;调控作用
随着新一代测序技术和平铺阵列(tiling arrays)等测序技术的发展,非编码RNA逐渐被挖掘并确认为基因组的组成和功能部件[1-2]。非编码RNA指不编码蛋白质的RNA,其中一部分为持家非编码RNA,如tRNAs、rRNAs和小核酸RNAs,另一部分在植物生长发育和胁迫反应中起重要的调节作用,如microRNAs和siRNA[3]。长非编码RNA(lncRNAs)是一类长度超过200 nt的转录本,其主要位于细胞核内和胞浆内[4]。根据lncRNAs具有基因组定位、DNA/RNA功能定位、靶向作用机制等特点,将其分为3个亚群:长非编码天然反义转录(lnc-NATs)、内含子长非编码RNAs和基因间长非编码RNAs。大多数长非编码RNAs被认为由RNA聚合酶II通过5′帽子和3′poly-A尾巴转录而来[5-7]。研究表明,在植物中,lncRNAs也可由Pol II、IV和V转录而来,其中部分缺失poly-A尾巴[8]。功能分析表明,lncRNAs可进行顺式和反式基因转录,并作为“支架”用于染色质复合物,其以RNA的形式参与蛋白编码基因的调控,转录后调控,转录激活、干扰,X染色体沉默和染色质修饰等多种重要的调控过程[9-10]。
近年来,lncRNAs虽然受到很多研究领域的关注,但仅有少数lncRNAs的功能研究相对深入。……
