胡鸣颖+徐耕

[关键词]冠心病；遗传变异；遗传基础

中图分类号：R541.4 文献标识码：A 文章编号：1009-816X（2015）05-0401-04

冠心病（coronary hearat disease，CHD）主要由以冠状动脉狭窄或闭塞为形态学改变的缺血性心脏病。家族史、年龄、性别、糖尿病、吸烟、高血压、高胆固醇血症和肥胖是早已公知的风险因素。环境因素如吸烟、饮食、运动、饮酒、胎儿宫内感染和空气污染对该病有较强影响。此外，研究发现许多CHD新的风险因素如同型半胱氨酸（Hcy）升高，纤维蛋白原和c反应蛋白升高，高密度脂蛋白水平降低，辅酶Q10、一氧化氮、维生素D和维生素K不足等。

CHD是一种复杂的疾病，由遗传和环境因素以及两者之间相互作用驱动。随着成本效益和高通量技术的发展，单核苷酸多态性（single nucleotide poly-morphism，SNP）基因分型，外显子组，基因组，核糖核酸（RNA）测序，基因表达微阵列和代谢分析已启用的集合数百万个体的数以千计的数据点。这样庞大数据的读出，需要有效的分析方法。本文回顾并突出该领域一些主要成果，以利揭开CHD遗传基础的潜力，预测基因风险评分（genomis risk scores，GRS），理清基础疾病复杂的相互作用，并预测对治疗的反应。

1.遗传基础

CHD的遗传结构研究最初是基于单变量全基因组关联（genome-wide association study，GWAS），亦名基因组广泛扫描，比较CHD组与对照组（无CHD）的SNP频率，观察多种遗传变异和环境因素之间的相互作用，推测各变异赋予的疾病风险。CWAS数据集研究逐年增多，有研究发现SNP使CHD的风险增加15%-20%（杂合变异）和30%-40%（纯合变异）。染色体9p21上一大段多个基因位点与CHD密切相关，其中9p21.3位点因重复性极高而通过全球验证。……