高邮鸭群体MSTN、MyoD1和MyoG基因外显子中SNP位点的分析

刘宏祥，徐文娟，宋卫涛，朱文奇，胡艳，姬改革，李慧芳

(江苏省家禽科学研究所，江苏扬州225125)

摘要：MSTN、MyoD1和MyoG基因与禽类骨骼肌的生长发育密切相关。本试验以高邮鸭为素材，对MSTN、MyoD1和MyoG 3个基因的外显子单核苷酸多态性(SNP)位点进行了鉴定，并对这些位点对蛋白质的影响及群体遗传信息进行了分析。结果显示，MSTN、MyoD1和MyoG 3个基因的外显子分别有9个、4个和7个SNP位点，其中具有中度多态的位点分别为8个、1个和5个，有义突变各1个，这些有义突变均改变了相应蛋白质的理化性质以及二级结构。

关键词：MSTN；MyoD1；MyoG；外显子；单核苷酸多态性；鸭

doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2015.03.023

收稿日期：2014-12-30

基金项目：国家自然科学基金项目(31172194)；江苏省科技支撑计划项目(BE2011329、BE2012460)；现代农业品种创新项目[CX(11)1030]

作者简介：刘宏祥(1985-)，男，江苏扬州人，硕士，主要从事家禽遗传育种与资源保护研究。(Tel)13665203762;(E-mail)liuhongxiangzai@163.com

中图分类号：S834`+.89

文献标识码：A

文章编号：1000-4440(2015)03-0604-09

Abstract：There are strong relations between MSTN, MyoD1, MyoG genes and development of skeletal muscle. The single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the exons of MSTN, MyoD1 and MyoG genes of Gaoyou duck were detected, and their influences on proteins and population genetics information were studied. There were nine, four SNPs and seven SNPs in the exons of MSTN, MyoD1 and MyoG genes, respectively, among which, eight, one and five SNPs were moderate polymorphic. One sense mutation detected in each gene changed the protein physico-chemical characteristics and second structure.

Analysis of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in exons ofMSTN, MyoD1 andMyoGgenes of Gaoyou duck

LIU Hong-xiang,XU Wen-juan,SONG Wei-tao,ZHU Wen-qi,HU Yan,JI Gai-ge,LI Hui-fang

(JiangsuInstituteofPoultryScience,Yangzhou225125,China)

Key words：MSTN;MyoD1;MyoG;exon;single nucleotide polymorphism (SNP);duck

动物机体的生长是一个复杂的生理过程，对肌肉生长具有调节作用的因子很多，其中重要的有MRFs(Muscle regulation factors)家族的MyoD1基因、MyoG基因，它们对肌肉生长具有正向调节功能；而TGFβ家族中的MSTN基因对肌肉生长具有负调控作用，其功能的缺失在哺乳动物中能够引起肌肉的显著增大[2-4]。

具有编码蛋白质功能的基因在DNA水平上的碱基序列变化将传递给蛋白质，而蛋白质序列的改变将影响蛋白质二级结构以及高级结构，甚至改变蛋白质的功能。基因组水平上的单个核苷酸的变异(SNP)在染色体上数量多、分布广，而且能够稳定遗传。……