王晓辉，曹洪玉，张庆芳，迟乃玉

（大连大学 生命科学与技术学院，辽宁 大连 116622）

低温几丁质酶chiA基因克隆、同源建模及序列分析

王晓辉，曹洪玉，张庆芳，迟乃玉

（大连大学 生命科学与技术学院，辽宁 大连 116622）

从假交替单胞菌（Pseudoalteromonas sp. DL-6）中克隆低温几丁质酶chiA基因（GenBank登录号KF234015）。该序列全长3160个核苷酸，编码1053个氨基酸，预测相对分子质量113.5 KDa，等电点（pI）4.49，命名为chiA。功能结构域分析显示其编码区包含信号肽、2个几丁质结合域、2个成人多囊肾病结构域、18家族几丁质酶催化域与18家族糖苷水解酶C端部分序列。利用Discovery Studio平台以同源建模的方法构建低温几丁质酶chiA的催化域三维结构模型，并对其进行结构优化和评估，Ramachandram图谱检测和Verify-3D评估显示模拟出的模型结构合理，整体的相容性较为可信。本结果拟为后期低温几丁质酶chiA的催化机理研究提供理论依据。

低温几丁质酶chiA；假交替单胞菌；同源模建；序列分析

几丁质是海洋环境含量最丰富的可再生资源，据估测，海洋环境每年超过1011吨几丁质形成，其降解主要是通过产几丁质酶的微生物完成[1]。酶法降解主要通过内切酶随机切割多糖链，外切酶沿糖链末端降解，整个水解过程是通过糖苷水解酶系来完成的[2]。酶法高效降解具有反应条件温和，无污染，降解过程易控制等优点，是国内外利用可再生资源的发展方向[3]。几丁质酶(chitinase, chi, EC3.2.1.14)降解几丁质生产的几丁寡糖、几丁单糖及其衍生物由于具有良好的组织兼容性和生物降解性以及调节免疫力和抗癌的保健功能等特点，在医药、食品、农业、工业等领域有着广泛的应用前景[4,5]。……