姜学革，常 德，黄佩佳，刘 岩，苏龙翔，朱远方，刘长庭

1解放军总医院 南楼呼吸科，北京 100853；2武警总医院 呼吸科，北京 100039；3深圳华大基因研究院，广东深圳 518083

基础研究论著

空间环境诱导屎肠球菌株的转录组序列测定与分析

姜学革1，常 德2，黄佩佳1，刘 岩1，苏龙翔1，朱远方3，刘长庭1

1解放军总医院 南楼呼吸科，北京 100853；2武警总医院 呼吸科，北京 100039；3深圳华大基因研究院，广东深圳 518083

目的对屎肠球菌进行全转录组测序，对比空间环境作用后菌株的基因表达差异。方法提取菌株总RNA并进行测序文库构建，利用第二代高通量测序技术进行测序，对原始测序数据进行过滤、组装、注释和分析，并通过比对地面对照菌株的转录组分析空间飞行后屎肠球菌株的基因表达差异。结果空间环境作用于屎肠球菌后，大量基因表达出现差异，包括1 036个基因表达下调，123个基因表达上调，基因本体功能和京都基因与基因组信号通路注释表明差异表达基因主要分布于生长和代谢相关通路。结论屎肠球菌全转录组测序和分析明确，空间飞行后的屎肠球菌生长和代谢相关基因表达改变。

空间环境；屎肠球菌；转录组；测序

屎肠球菌属于革兰阳性肠球菌群，是人和动物肠道的定植菌群，可生长在各种植物、动物、昆虫体内，也可在其他环境中生长[1-2]。肠球菌属以往被认为能抑制哺乳动物胃肠道内其他细菌的生长，是一种无害的共生菌，故常作为益生菌加入到食品中[3-4]。后续的研究表明，某些肠球菌属于条件致病菌，可引起人体多系统感染[5]。……