南通地区2014年肠道病毒71型的分子流行病学研究*
2015-03-21张宏萍陆仁飞李雪梅
张宏萍,周 敏,陆仁飞,李雪梅
(1.南通市疾病预防控制中心,江苏南通 226001;2.江苏省南通市第三人民医院,江苏南通 226001)
南通地区2014年肠道病毒71型的分子流行病学研究*
张宏萍1,周 敏1,陆仁飞2,李雪梅2
(1.南通市疾病预防控制中心,江苏南通 226001;2.江苏省南通市第三人民医院,江苏南通 226001)
目的分析2014年江苏南通地区肠道病毒71型(EV71)的分子流行病学特征。方法采集52例手足口病患儿咽拭子标本,提取病毒核酸,采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)扩增病毒的VP1序列。获得的序列与来自其他地区的序列进行比对分析,构建系统发育树。结果52份临床标本中分离到12株EV71 VP1序列,12株VP1序列的核苷酸、氨基酸同源性为93.4%~99.1%,进化树分析显示12株VP1序列全部属于C4基因型的C4a亚型。结论2014年南通地区分离的EV71流行病毒株与近年来中国其他地区的流行株有相同的起源,均属于EV71 C4基因的C4a亚型。
肠道病毒71型; 基因特征; 分子流行病学
肠道病毒71型(EV71)属于小RNA病毒科,肠道病毒属,其核酸为单股正链RNA,是引起婴幼儿手足口病的主要病原体,还能引起无菌性肠膜炎,脑干脑炎和骨髓灰质炎样的麻痹与多种神经系统的疾病[1]。1969年,美国加州首次报道了EV71引起的病例[2],此后,全球各地均有流行。我国各地区对EV71流行爆发均有报道[3-5],本研究对2014年江苏南通地区手足口病分离的EV71 VP1区进行扩增测序,旨在了解本地区近段时间EV71的流行趋势及分子流行病学特征。
1 材料与方法
1.1 材料 标本来源于2014年南通地区各医院手足口病住院患儿,采集患儿咽拭子标本于病毒储存液中,-80℃保存。……
