miR- 29a和miR- 142- 3p促进髓系分化的基因调控网络
2014-11-27马艳妮赵华路张俊武
董 贺,马艳妮,董 磊,赵华路,张俊武,王 芳,余 佳
(中国医学科学院 基础医学研究所 北京协和医学院 基础学院 国家医学分子生物学重点实验室, 北京 100005)
miR- 29a和miR- 142- 3p促进髓系分化的基因调控网络
董 贺,马艳妮,董 磊,赵华路,张俊武,王 芳,余 佳*
(中国医学科学院 基础医学研究所 北京协和医学院 基础学院 国家医学分子生物学重点实验室, 北京 100005)
目的深入了解miR- 29a/miR- 142- 3p参与促进髓系分化的调控网络。方法首先实现miR- 29a和miR- 142- 3p在HL- 60细胞中的过表达,同时使用PMA以及ATRA分别诱导HL- 60细胞向单核及粒系分化。May-Grünwald-Giemsa染色方法观察核形态变化,Real-time PCR检测细胞内CD11和CD14的表达。mRNA表达谱芯片分析获得表达模式相似的基因,利用DAVID和GeneMANIA进行GO categories 和信号通路归类分析。PicTar和TargetScan进行靶基因预测,双荧光报告基因实验确定靶基因的真实性。结果miR- 29a/miR- 142- 3p过表达细胞与PMA/ATRA诱导分化细胞在整体基因表达模式上有较高的相似度,而表达模式相似的基因大多与细胞分化相关,且在GO分析中显著富集。同时,ZBTB5、CaMKK2、SUV420H2、TRIB2和CANX被确定为miR- 29a新的靶基因。结论miR- 29a/miR- 142- 3p通过调节其靶基因活性,引发整个基因表达调控网络的改变,使之趋向于髓系分化过程中的基因表达变化,从而促进髓系分化进程。
miR- 29a; miR- 142- 3p; 髓系分化;基因表达; GO分析
造血是贯穿人一生的重要生理过程,涉及多潜能造血干细胞(hematopoietic stem cells, HSC)的自我更新和向不同链系细胞的分化决定并进一步分化发育成熟。HSC首先分化成共同淋巴样祖细胞(common lymphoid progenitor, CLP)和共同髓样祖细胞(common myeloid progenitor, CMP)。CMP进一步分化成巨核/红系双潜能祖细胞(megakaryocytic-erythroid progenitor, MEP)和粒系/单核系祖细胞(granulocyte-monocyte progenitor, GMP)。GMP经过髓样分化细胞限制的途径分化发育成粒细胞、单核细胞,这一过程又称为髓系分化[1- 2]。……
