蛋白质亚细胞定位预测研究进展
2014-09-02郑珊珊石卓兴代琦姚玉华
科技视界 2014年12期
郑珊珊+石卓兴+代琦+姚玉华
【摘 要】蛋白质的功能与其亚细胞位置有着密切的联系,对于确定一个未知特性蛋白质的功能,亚细胞定位研究能够提供重要的参考信息。采用传统实验的方法研究亚细胞定位需要耗费大量的人力、财力、物力,已经不能满足数据库中蛋白质序列爆炸性增长的现实需要。从已积累的知识和数据出发,利用智能算法、机器学习等工具开发蛋白质亚细胞定位预测的方法成为了当前的重要研究内容。本文对国内外亚细胞定位预测的研究现状进行了综述。
【关键词】亚细胞定位;特征信息提取;预测算法
亚细胞定位是指某种蛋白或某种基因表达产物在细胞内的具体存在部位,即根据所给出的蛋白质序列来预测其所在的亚细胞位置。蛋白质是基因功能的执行者,机体中的每一个细胞和所有重要组成部分都有它的参与,正是由于它是与生命及与各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质,越来越多的生物学、生物信息学研究者开始对蛋白质的功能预测及分析进行了研究。然而,蛋白质只有经分选信号引导后运输到特定的细胞器中,才能参与细胞的各种生命活动,执行它的功能,如果其运送位置发生偏差,将会影响细胞功能甚至整个生物体。因此,蛋白质在细胞中的正确定位是细胞系统高度有序运转的前提保障。研究细胞中蛋白质定位的机制和规律,预测蛋白质的亚细胞定位,对于了解蛋白质结构、性质和功能,了解蛋白质之间的相互作用,研究疾病机理和发展新药物以及探索生命的规律和奥秘具有重要意义。……
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