MALDI-TOF-MS鉴定宋内志贺菌的临床应用
2014-06-07鲍春梅宋新爱崔恩博王欢张鞠玲陈素明张成龙贾天野曲芬毛远丽
鲍春梅,宋新爱,崔恩博,王欢,张鞠玲,陈素明,张成龙,贾天野,曲芬,毛远丽
MALDI-TOF-MS鉴定宋内志贺菌的临床应用
鲍春梅,宋新爱,崔恩博,王欢,张鞠玲,陈素明,张成龙,贾天野,曲芬,毛远丽
目的建立基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flightmass spectrometry,MALDI-TOF-MS)鉴定宋内志贺菌的质谱数据库,实现对临床分离宋内志贺菌的快速鉴定。方法建立经提取法处理后鉴定宋内志贺菌的质谱数据库。在分别使用直接涂抹法和提取法处理后对200株宋内志贺菌野生株进行鉴定验证;同时针对宋内志贺菌的不同菌相、不同激光强度和不同样本保存时间分别进行MALDI-TOF-MS鉴定。再选取100株大肠埃希菌,进行MALDI-TOF-MS鉴定,以确定新建数据库的特异性。结果宋内志贺菌经提取法处理后的鉴定符合率为100%,经直接涂抹法处理后的鉴定符合率为71.5%。宋内志贺菌不同菌相和不同激光强度的鉴定结果差异无统计学意义(P>0.05);而样本不同保存时间鉴定结果差异有统计学意义(P<0.05)。使用新数据库后,大肠埃希菌鉴定符合率为96.0%。结论经提取法处理后应用MALDI-TOF-MS鉴定宋内志贺菌建立的质谱数据库,能快速、准确鉴定宋内志贺菌到种水平,满足腹泻病原菌临床分离株的快速诊断。
志贺菌属;提取法;微生物学;图谱
宋内志贺菌属于志贺菌D群,是引起胃肠道感染的主要病原菌之一,老人、儿童和免疫功能受损的患者多发。发达国家流行的主要是宋内志贺菌,而发展中国家虽然长期以来流行的为福氏志贺菌,但近年来宋内志贺菌呈明显增加的趋势,并成为优势菌群[1]。……
