常染色体显性遗传性多囊肾家系PKD1、PKD2基因突变分析
2014-03-21骆杰伟孟晓嵘郑星宇魏世超张雪梅范丁前
骆杰伟 孟晓嵘 郑星宇 魏世超 胡 丹 杨 笑 张雪梅 范丁前
常染色体显性遗传性多囊肾病(ADPKD)是很常见的单基因遗传性疾病,是终末期肾病(ESRD)的最常见的遗传病因[1],在全世界范围内有0.12亿人发病[2];中国肾移植科学登记系统数据显示,囊性肾脏病(3.5%)占中国ESRD第四位病因[3]。目前至少发现3个基因与本病有关,已明确的是定位于16p13.3的PKD1基因和定位于4q21的PKD2基因,分别编码多囊蛋白1(PC1)和多囊蛋白2(PC2) 。与PKD1突变有关的患者至少占85%,而与PKD2有关的≤15%;尚有可能不明确的第三种基因与之有关。PKD1患者较PKD2患者病情重,发病早[4,5]。此研究试图用华大基因(BGI)外显子序列捕获技术平台检测一个多囊肾家系突变方式。
对象与方法
研究对象本家系先证者来自于福建省立医院住院患者,44岁男性,汉族,临床表现为腰酸、肉眼血尿、腹胀、高血压、泌尿系感染、双肾多发结石、胸腔积液等。并收集本家系相关成员共8个血样及临床资料,其中包括先行收集的已故的先证者母亲Ⅱ4,而先证者妹妹(40岁)Ⅲ5在同期表现出上述症状。多囊肾诊断参考Ravine等[6]提出超声诊断:(1)<30岁患者单侧或双侧有≥2个囊肿;(2)30~59岁患者双侧肾囊肿≥2个;(3)≥60岁患者双侧肾囊肿≥4个;(4)如果具有家族史或多囊肝等肾外表现或基因检测,诊断标准可适当放宽。
经医院医学伦理委员会同意,受试者均签署知情同意书。
研究方法
临床表型检测根据先证者及家系成员临床表现行肝肾彩超、电子计算机X射线断层扫描技术(CT)或核磁共振等检测,采集血、尿常规、生化全套等。
基因组DNA的提取抽取先证者15 ml外周血及家系其他7名成员抽取2 ml外周血,按试剂盒(Omega E.Z.N.A.® Tissue DNA Kit)说明书方法提取基因组DNA。
Illumina测序[7,8]及生物信息学分析[9](1)样品检测:先证者DNA样品由Nanodrop 2000检测浓度,取3 μg以上DNA样品用于DNA片段化。……
