中国沿海鲆鲽鱼类进化关系研究
2014-01-21方一锋
■方一锋
(浙江自然博物馆生命科学部,浙江杭州310003)
鲆鲽鱼类是鲽形目(Pleuronectiformes)鱼类的总称,俗称比目鱼(Flatfishes),在海洋鱼类中占有十分重要的地位。鲆鲽鱼类广泛分布于全球各海域,其中的牙鲆、大菱鲆、圆斑星鲽、大西洋庸鲽和半滑舌鳎等品种均为我国沿海重要的经济鱼类,其中中国本地种类的经济鱼种并不多,上述鱼种中只有半滑舌鳎的模式产地为中国。
生物间群体遗传结构和进化关系的研究是生物学研究的基础和重要组成部分。目前利用分子遗传学手段,揭示物种演化关系,已经成为研究生物系统进化的趋势。本研究中的53种鲆鲽鱼类,基本涵盖了我国沿海鲽形目的代表种属。利用线粒体DNA的COI基因的部分序列作为分子标记,比较我国沿海鲽形目鱼类进化关系,以期为鲆鲽鱼类分类及修订提供一定的参考。
1 材料与方法
1.1 线粒体COI序列检索
使用 NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)数据库,检索鲆鲽鱼的线粒体COI基因序列。
1.2 系统进化分析
系统进化分析采用鲆科的大菱鲆(S.maximus),鲽科的大西洋庸鲽(H.hippoglossus)和鳎科的欧鳎(S.solea)作为外群。用ClustalX软件对各鲆鲽鱼的线粒体COI序列进行多重序列比对和分析。针对多重序列比对结果,使用MEGA6软件借助于邻接法(Neighbour-Joining,NJ)和最大似然法(Maximum likelihood,ML)构建系统进化树。
2 结果与分析
2.1 NCBI检索结果
通过NCBI检索,分布于中国沿海的鲆鲽鱼共有53种公布了COI序列(表1),其中包括模式产地为中国的鲆鲽鱼15种,分别为:中华舌鳎(C.sinicus)、长吻红舌鳎(C.lighti)、短吻红舌鳎(C.joyneri)、短吻三线舌鳎(C.abbreviatus)、半滑舌鳎(C.semilaevis)、双线舌鳎(C.bilineatus)、黑鳃舌鳎(C.roulei)、斑头舌鳎……
